Visualizing a viral genome with contrast variation small angle X-ray scattering
Visualizing a viral genome with contrast variation small angle X-ray scattering
复制标题
通过小角度 X 射线散射对比变化可视化病毒基因组
DOI：
10.1074/jbc.ra120.013961
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发表时间：
2020
影响因子：
4.8
通讯作者：
Pollack, Lois
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
San Emeterio, Josue;Pollack, Lois
尽管一些单链RNA病毒对人类健康构成威胁，但人们对它们的组装知之甚少。这项工作的目标是引入一种新的工具，用于观察RNA基因组通过蛋白质引导其自身的包装和组装。对比度变化小角X射线散射（CV-SAXS）是一种强大的工具，有可能通过这种组装过程来监测病毒RNA结构的变化。蛋白质虽然存在，但对测量的信号没有贡献。作为评估病毒基因组研究的可行性的第一步，用CV-SAXS专门检测了双核苷化MS 2 RNA的结构，并与来自不对称冷冻EM重建的结构进行了比较。与游离RNA的额外比较突出了衣壳蛋白诱导的显著结构重排，并邀请应用时间分辨CV-SAXS来揭示导致有效病毒组装的相互作用。
Despite the threat to human health posed by some single-stranded RNA viruses, little is understood about their assembly. The goal of this work is to introduce a new tool for watching an RNA genome direct its own packaging and encapsidation by proteins. Contrast variation small-angle X-ray scattering (CV-SAXS) is a powerful tool with the potential to monitor the changing structure of a viral RNA through this assembly process. The proteins, though present, do not contribute to the measured signal. As a first step in assessing the feasibility of viral genome studies, the structure of encapsidated MS2 RNA was exclusively detected with CV-SAXS and compared with a structure derived from asymmetric cryo-EM reconstructions. Additional comparisons with free RNA highlight the significant structural rearrangements induced by capsid proteins and invite the application of time-resolved CV-SAXS to reveal interactions that result in efficient viral assembly.
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影响因子：
4.4
作者：
Dika, C.;Duval, J. F. L.;Gantzer, C.
通讯作者：
Gantzer, C.
影响因子：
8.6
作者：
Drozdetski AV;Tolokh IS;Pollack L;Baker N;Onufriev AV
通讯作者：
Onufriev AV
DOI：
10.1261/rna.068361.118
发表时间：
2018-12
期刊：
RNA (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Welty R;Pabit SA;Katz AM;Calvey GD;Pollack L;Hall KB
通讯作者：
Hall KB
影响因子：
16.6
作者：
Shakeel S;Dykeman EC;White SJ;Ora A;Cockburn JJB;Butcher SJ;Stockley PG;Twarock R
通讯作者：
Twarock R
Leviviridae 的冷冻电子显微镜重建揭示了可能的最致密的二十面体 RNA 堆积。
影响因子：
5.6
作者：
S. V. D. van den Worm;R. Koning;Hans Warmenhoven;H. Koerten;J. van Duin
通讯作者：
J. van Duin