Modelling the spread of American foulbrood in honeybees.
Modelling the spread of American foulbrood in honeybees.
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DOI：
10.1098/rsif.2013.0650
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发表时间：
2013-11-06
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Keeling MJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Datta S;Bull JC;Budge GE;Keeling MJ
我们调查了美国幼虫病（AFB）的传播，这是一种由类芽孢杆菌幼虫引起的疾病，它影响蜜蜂，对蜂箱的破坏性极大。我们的数据集来自于2010年夏天泽西岛上的蜂群在AFB流行期间进行的检查。这些数据包括蜜蜂蜂巢的数量，全岛蜜蜂养蜂场的位置和所有者。我们使用一个空间SIR模型与底层业主网络来模拟流行病和特征的流行病，使用马尔可夫链蒙特卡罗（MCMC）计划，以确定模型参数和感染时间（包括未检测到的“隐匿性”感染）。从分析中可以推断出感染传播的可能方法，发现基于距离和所有者的传播都有助于AFB的传播。MCMC的结果得到证实，通过模拟流行病使用随机SIR模型，导致总感染水平的数据是可比的。我们使用这个随机SIR模型来模拟不同的控制策略对控制流行病的影响。发现早期检查导致较小的流行和较高的AFB灭绝的可能性。
We investigate the spread of American foulbrood (AFB), a disease caused by the bacterium Paenibacillus larvae, that affects bees and can be extremely damaging to beehives. Our dataset comes from an inspection period carried out during an AFB epidemic of honeybee colonies on the island of Jersey during the summer of 2010. The data include the number of hives of honeybees, location and owner of honeybee apiaries across the island. We use a spatial SIR model with an underlying owner network to simulate the epidemic and characterize the epidemic using a Markov chain Monte Carlo (MCMC) scheme to determine model parameters and infection times (including undetected ‘occult’ infections). Likely methods of infection spread can be inferred from the analysis, with both distance- and owner-based transmissions being found to contribute to the spread of AFB. The results of the MCMC are corroborated by simulating the epidemic using a stochastic SIR model, resulting in aggregate levels of infection that are comparable to the data. We use this stochastic SIR model to simulate the impact of different control strategies on controlling the epidemic. It is found that earlier inspections result in smaller epidemics and a higher likelihood of AFB extinction.
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DOI：
10.1111/1467-985x.00125
发表时间：
1999-01-01
影响因子：
2
作者：
O'Neill, PD;Roberts, GO
通讯作者：
Roberts, GO
影响因子：
4.4
作者：
Jewell, Chris P.;Kypraios, Theodore;Roberts, Gareth O.
通讯作者：
Roberts, Gareth O.
影响因子：
3.9
作者：
Jewell, C. P.;Keeling, M. J.;Roberts, G. O.
通讯作者：
Roberts, G. O.
影响因子：
3.4
作者：
Miyagi, T;Peng, CYS;Doi, RH
通讯作者：
Doi, RH
影响因子：
2.4
作者：
Pentikainen, Jaana;Kalliainen, Eija;Pelkonen, Sinikka
通讯作者：
Pelkonen, Sinikka