Expression profiles of human interferon-alpha and interferon-lambda subtypes are ligand- and cell-dependent.
Expression profiles of human interferon-alpha and interferon-lambda subtypes are ligand- and cell-dependent.
复制标题
DOI：
10.1038/icb.2011.109
复制
发表时间：
2012-09
影响因子：
4
通讯作者：
Rabin, Ronald L.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Hillyer, Philippa;Mane, Viraj P.;Schramm, Lynnsie M.;Puig, Montserrat;Verthelyi, Daniela;Chen, Aaron;Zhao, Zeng;Navarro, Maria B.;Kirschman, Kevin D.;Bykadi, Srikant;Jubin, Ronald G.;Rabin, Ronald L.
最近的全基因组关联研究表明，12种人干扰素-α（IFN-α）和3种IFN-λ亚型的不同作用可以通过定义这些基因组的表达模式来阐明。为了克服各组之间高同源性的障碍，我们设计了一种定量实时PCR测定，其结合使用分子信标和锁核酸（LNA）探针，并且在某些情况下，LNA寡核苷酸抑制剂。然后，我们测量了人外周血单核细胞以及纯化的单核细胞、骨髓树突状细胞（mDC）、浆细胞样树突状细胞（pDC）和单核细胞衍生的巨噬细胞（MDM）和树突状细胞（MDDC）对poly I：C、脂多糖（LPS）、咪喹莫特和CpG寡核苷酸的反应中IFN亚型的表达。我们发现，在对poly I：C和LPS的应答中，单核细胞、MDM和MDDC表达主要限于IFN-β和IFN-λ1的亚型模式。此外，虽然CpG引起pDC表达所有I型IFN亚型，但咪喹莫特没有。此外，MDM和mDC高度表达IFN-λ，并且IFN-λ的亚型以IFN-λ1、IFN-λ2和IFN-λ3的顺序分层表达。这些数据支持协调的细胞和配体特异性表达的I型和III型IFN的模型。在各种情况下定义IFN亚型表达谱可以阐明IFN亚型作为保护性、治疗性或致病性介质的特定作用。
Recent genome-wide association studies suggest distinct roles for 12 human interferon-alpha (IFN-α) and 3 IFN-λ subtypes that may be elucidated by defining the expression patterns of these sets of genes. To overcome the impediment of high homology among each of the sets, we designed a quantitative real-time PCR assay that incorporates the use of molecular beacon and locked nucleic acid (LNA) probes, and in some instances, LNA oligonucleotide inhibitors. We then measured IFN subtype expression by human peripheral blood mononuclear cells and by purified monocytes, myeloid dendritic cells (mDC), plasmacytoid dendritic cells (pDC), and monocyte-derived macrophages (MDM), and –dendritic cells (MDDC) in response to poly I:C, lipopolysaccharide (LPS), imiquimod and CpG oligonucleotides. We found that in response to poly I:C and LPS, monocytes, MDM and MDDC express a subtype pattern restricted primarily to IFN-β and IFN-λ1. In addition, while CpG elicited expression of all type I IFN subtypes by pDC, imiquimod did not. Furthermore, MDM and mDC highly express IFN-λ, and the subtypes of IFN-λ are expressed hierarchically in the order IFN-λ1 followed by IFN-λ2, and then IFN-λ3. These data support a model of coordinated cell- and ligand-specific expression of types I and III IFN. Defining IFN subtype expression profiles in a variety of contexts may elucidate specific roles for IFN subtypes as protective, therapeutic or pathogenic mediators.
登录
查看更多内容
影响因子：
15.9
作者：
Antonelli, Lis R. V.;Rothfuchs, Antonio Gigliotti;Sher, Alan
通讯作者：
Sher, Alan
DOI：
10.1073/pnas.0901329106
发表时间：
2009-06-02
影响因子：
11.1
作者：
Critchley-Thorne, Rebecca J.;Simons, Diana L.;Lee, Peter P.
通讯作者：
Lee, Peter P.
影响因子：
--
作者：
Hirankarn, N.;Tangwattanachuleeporn, M.;Avihingsanon, Y.
通讯作者：
Avihingsanon, Y.
影响因子：
5.4
作者：
Coccia, EM;Severa, M;Uzé, G
通讯作者：
Uzé, G
影响因子：
5.3
作者：
Genin, Pierre;Lin, Rongtuan;Civas, Ahmet
通讯作者：
Civas, Ahmet