Shared and distinct transcriptomic cell types across neocortical areas.
Shared and distinct transcriptomic cell types across neocortical areas.
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DOI：
10.1038/s41586-018-0654-5
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发表时间：
2018-11
期刊：
影响因子：
64.8
通讯作者：
Zeng H
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Tasic B;Yao Z;Graybuck LT;Smith KA;Nguyen TN;Bertagnolli D;Goldy J;Garren E;Economo MN;Viswanathan S;Penn O;Bakken T;Menon V;Miller J;Fong O;Hirokawa KE;Lathia K;Rimorin C;Tieu M;Larsen R;Casper T;Barkan E;Kroll M;Parry S;Shapovalova NV;Hirschstein D;Pendergraft J;Sullivan HA;Kim TK;Szafer A;Dee N;Groblewski P;Wickersham I;Cetin A;Harris JA;Levi BP;Sunkin SM;Madisen L;Daigle TL;Looger L;Bernard A;Phillips J;Lein E;Hawrylycz M;Svoboda K;Jones AR;Koch C;Zeng H
新皮层包含多种细胞类型，这些细胞被划分成不同的层和功能不同的区域。为了研究小鼠新皮层中细胞类型的多样性，我们分析了小鼠新皮层两个远极区域的23,822个细胞：初级视觉皮层和前外侧运动皮层。我们通过深度单细胞RNA测序定义了133种转录组细胞类型。几乎所有类型的GABA （γ-氨基丁酸）神经元在两个区域共享，而大多数类型的谷氨酸能神经元在两个区域中的一个被发现。通过结合单细胞RNA测序和逆行标记，我们将谷氨酸能神经元的转录组类型与其远程投射特异性相匹配。我们的研究建立了来自成年小鼠皮层功能不同区域的皮层细胞类型的转录组学和投影分类法。
The neocortex contains a multitude of cell types that are segregated into layers and functionally distinct areas. To investigate the diversity of cell types across the mouse neocortex, here we analysed 23,822 cells from two areas at distant poles of the mouse neocortex: the primary visual cortex and the anterior lateral motor cortex. We define 133 transcriptomic cell types by deep, single-cell RNA sequencing. Nearly all types of GABA (γ-aminobutyric acid)-containing neurons are shared across both areas, whereas most types of glutamatergic neurons were found in one of the two areas. By combining single-cell RNA sequencing and retrograde labelling, we match transcriptomic types of glutamatergic neurons to their long-range projection specificity. Our study establishes a combined transcriptomic and projectional taxonomy of cortical cell types from functionally distinct areas of the adult mouse cortex.
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影响因子：
4.8
作者：
Bondjers, Cecilia;He, Liqun;Betsholtz, Christer
通讯作者：
Betsholtz, Christer
影响因子：
46.9
作者：
Cadwell CR;Palasantza A;Jiang X;Berens P;Deng Q;Yilmaz M;Reimer J;Shen S;Bethge M;Tolias KF;Sandberg R;Tolias AS
通讯作者：
Tolias AS
DOI：
10.1073/pnas.0605965104
发表时间：
2007-01-02
影响因子：
11.1
作者：
Fortunato, Santo;Barthelemy, Marc
通讯作者：
Barthelemy, Marc
影响因子：
3.7
作者：
Abellan, Antonio;Menuet, Arnaud;Retaux, Sylvie
通讯作者：
Retaux, Sylvie
影响因子：
16.6
作者：
Frazer S;Prados J;Niquille M;Cadilhac C;Markopoulos F;Gomez L;Tomasello U;Telley L;Holtmaat A;Jabaudon D;Dayer A
通讯作者：
Dayer A