Application of High-Field Asymmetric Waveform Ion Mobility Separation to LESA Mass Spectrometry of Bacteria.
Application of High-Field Asymmetric Waveform Ion Mobility Separation to LESA Mass Spectrometry of Bacteria.
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高场不对称波形离子淌度分离在细菌 LESA 质谱分析中的应用。
DOI：
10.1021/acs.analchem.9b00307
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发表时间：
2019
影响因子：
7.4
通讯作者：
Kocurek KI
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kocurek KI
我们以前已经证明了完整的蛋白质的分析直接从细菌菌落（包括革兰氏阴性和革兰氏阳性临床分离株）生长在琼脂培养基上的液体提取表面分析质谱法（LESA MS）。在这项工作中确定了几个挑战，包括（1）来自营养培养基的背景信号的干扰（大肠杆菌），（2）高密度的蛋白质峰，导致在单个窗口中分离多个蛋白质前体离子，并随后获得复合串联质谱（铜绿假单胞菌），和（3）过量的分泌肽抑制对应于蛋白质的峰（金黄色葡萄球菌）。在这里，我们提出了高场不对称波形离子迁移谱（FAIMS）分离到LESA MS协议的耦合，目的是解决上述挑战，从而提高LESA MS的细菌表征能力。结果表明，FAIMS的加入通过将背景峰与蛋白质信号分离，以及通过分离先前不能单独通过LESA MS分离的重叠蛋白质峰，扩大了检测蛋白质的范围。
We have previously demonstrated the analysis of intact proteins directly from bacterial colonies (including Gram-negative and Gram-positive clinical isolates) grown on agar media by liquid extraction surface analysis mass spectrometry (LESA MS). Several challenges were identified in that work, including (1) interference of background signal derived from the nutrient media (Escherichia coli), (2) a high density of protein peaks leading to the isolation of multiple protein precursor ions in a single window and consequent acquisition of composite tandem mass spectra (Pseudomonas aeruginosa), and (3) the overabundance of secreted peptides suppressing peaks corresponding to proteins (Staphylococcus aureus). Here, we present the coupling of high-field asymmetric waveform ion mobility spectrometry (FAIMS) separation into the LESA MS protocol, with the aim of resolving the aforementioned challenges and thus improving the capabilities of LESA MS for bacterial characterization. The results show that inclusion of FAIMS expands the range of detected proteins through separation of background peaks from protein signal, as well as through resolution of overlapping protein peaks which could not previously be isolated by LESA MS alone.
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伯明翰大学 LESA FAIMS 质谱法用于组织蛋白质的空间分析
DOI：
--
发表时间：
2016
期刊：
影响因子：
--
作者：
Rian L. Gri ffi ths;A. Creese;A. Race;J. Bunch;H. Cooper
通讯作者：
H. Cooper
影响因子：
7.4
作者：
Sarsby, Joscelyn;Griffiths, Rian L.;Cooper, Helen J.
通讯作者：
Cooper, Helen J.
DOI：
--
发表时间：
2004
期刊：
Nature Structural &Molecular Biology
影响因子：
--
作者：
A. Vila;B. Schuwirth;C. Hau;J. Cate
通讯作者：
J. Cate
铜绿假单胞菌PAK菌毛蛋白基因的克隆和测序
影响因子：
3.5
作者：
B. Pasloske;B. Finlay;W. Paranchych
通讯作者：
W. Paranchych
影响因子：
7.4
作者：
Griffiths, Rian L.;Simmonds, Anna L.;Cooper, Helen J.
通讯作者：
Cooper, Helen J.