Rapid haplotype inference for nuclear families.
Rapid haplotype inference for nuclear families.
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DOI：
10.1186/gb-2010-11-10-r108
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发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
Gifford DK
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Williams AL;Housman DE;Rinard MC;Gifford DK
Hapi是一种新的动态规划算法，它忽略了无信息状态和状态转换，以有效地计算最小重组和最大似然单体型。当应用于包含103个家庭的数据集时，Hapi的执行速度比最先进的算法快3.8和320倍。因为Hapi推断最小重组和最大似然单倍型，并适用于相关的个体，它推断的单倍型在扩展的基因组距离上是高度准确的。
Hapi is a new dynamic programming algorithm that ignores uninformative states and state transitions in order to efficiently compute minimum-recombinant and maximum likelihood haplotypes. When applied to a dataset containing 103 families, Hapi performs 3.8 and 320 times faster than state-of-the-art algorithms. Because Hapi infers both minimum-recombinant and maximum likelihood haplotypes and applies to related individuals, the haplotypes it infers are highly accurate over extended genomic distances.
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影响因子：
7
作者：
Lin, S;Chakravarti, A;Cutler, DJ
通讯作者：
Cutler, DJ
影响因子：
2.1
作者：
Andres, Aida M.;Clark, Andrew G.;Hixson, James E.
通讯作者：
Hixson, James E.
DOI：
10.1073/pnas.84.8.2363
发表时间：
1987-04-01
影响因子：
11.1
作者：
LANDER, ES;GREEN, P
通讯作者：
GREEN, P
影响因子：
9.8
作者：
O'Connell, JR;Weeks, DE
通讯作者：
Weeks, DE
影响因子：
30.8
作者：
Abecasis, GR;Cherny, SS;Cardon, LR
通讯作者：
Cardon, LR