[Molecular diagnosis of respiratory enterovirus infections: Use of PCR and molecular identification for a best approach of the main circulating strains during 2008].
[Molecular diagnosis of respiratory enterovirus infections: Use of PCR and molecular identification for a best approach of the main circulating strains during 2008].
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DOI：
10.1016/j.patbio.2010.07.010
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发表时间：
2011-04
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Vabret A
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Petitjean-Lecherbonnier J;Dina J;Nguyen E;Gouarin S;Lebigot E;Vabret A
Alors que la place de la PCR est bien reconnue pour le diagnostic des infections neuroméningées à entérovirus (EV), l’utilisation des techniques de biologie moléculaire dans les infections respiratoires à EV est encore mal définie. Définir les apports des outils moléculaires (PCR et génotypage) dans le diagnostic et l’épidémiologie des infections respiratoires à EV. Au cours de l’année 2008, 3612 sécrétions nasales ont eu une recherche virale par IFD et culture MRC5. Dans un second temps, sont réalisés une recherche virale sur culture HuH7 (SN négative en IF) et une PCR duplex entérorhinovirus (PEVRV) sur 816 surnageants de culture HuH7 présentant un ECP. De plus, 327 SN de nouveau-nés ont eu une recherche systématique par la PCR EV temps réel « maison » (PEV) utilisée pour le diagnostic des infections méningées. Un génotypage a été réalisé chez 68 patients présentant une identification d’EV sur surnageants de cultures MRC5 ou HuH7. Trente-cinq EV ont été isolés en culture (0,97 %) ; la combinaison des deux PCR, PEVRV et PEV, a permis d’identifier respectivement, 41 EV, 8 EV-RV et 12 RV supplémentaires, portant le nombre de positif à 96 (2,6 %). Chez les NN, 32 (11,3 %) SN sont positives avec la PEV. Parmi les 98 SN testées par PEV et PEVRV, 27 étaient positives et nous avons détecté dix EV, cinq EV-RV et 12 RV. De janvier à décembre 2008, la distribution saisonnière montre le pic estival habituel d’infections méningées et un pic automnal correspondant d’infections respiratoires. Cinq sérotypes prédominent : 19 EV68 (29,7 %), 12 CB3 (18,7 %), neuf E3 (14,1 %), six CA9 (9,4 %) et six CB1 (9,4 %). Les EV68 sont tous isolés en octobre à novembre et 17/19 (89,5 %) des patients positifs ont été hospitalisés avec des signes d’insuffisance respiratoire aiguë. Les méthodes de diagnostic moléculaires des infections respiratoires à EV (PCR et génotypage) permettent d’identifier précisément les souches circulantes dans un temps relativement court, apportant un bénéfice épidémiologique, clinique et économique de santé.
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影响因子：
3.1
作者：
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