A single-cell survey of the small intestinal epithelium.
A single-cell survey of the small intestinal epithelium.
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DOI：
10.1038/nature24489
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发表时间：
2017-11-16
期刊：
影响因子：
64.8
通讯作者：
Regev A
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Haber AL;Biton M;Rogel N;Herbst RH;Shekhar K;Smillie C;Burgin G;Delorey TM;Howitt MR;Katz Y;Tirosh I;Beyaz S;Dionne D;Zhang M;Raychowdhury R;Garrett WS;Rozenblatt-Rosen O;Shi HN;Yilmaz O;Xavier RJ;Regev A
肠上皮细胞（IEC）吸收营养，对微生物作出反应，提供屏障功能并帮助协调免疫反应。我们分析了来自小鼠小肠和类器官的53，193个个体上皮细胞，并表征了新的亚型及其基因特征。我们发现了意想不到的多样性的肠内分泌分泌细胞分泌蛋白，并建立了新的分类。我们区分了两种簇状细胞亚型，其中一种表达上皮细胞因子TSLP和CD45（Ptprc），这是以前与非造血细胞无关的泛免疫标记物。我们还表征了细胞内在状态和细胞比例对细菌和蠕虫感染的反应。沙门氏菌感染导致潘氏细胞和肠上皮细胞丰度增加，并广泛激活抗菌程序。相反，Heligmosomoides polygyrus引起的杯状和簇状细胞群的扩大。我们的调查强调了新的标记物和程序，将感觉分子与细胞类型联系起来，并揭示了肠道稳态和对病原体反应的原则。
Intestinal epithelial cells (IECs) absorb nutrients, respond to microbes, provide barrier function and help coordinate immune responses. We profiled 53,193 individual epithelial cells from mouse small intestine and organoids, and characterized novel subtypes and their gene signatures. We showed unexpected diversity of hormone-secreting enteroendocrine cells and constructed their novel taxonomy. We distinguished between two tuft cell subtypes, one of which expresses the epithelial cytokine TSLP and CD45 (Ptprc), the pan-immune marker not previously associated with non-hematopoietic cells. We also characterized how cell-intrinsic states and cell proportions respond to bacterial and helminth infections. Salmonella infection caused an increase in Paneth cells and enterocytes abundance, and broad activation of an antimicrobial program. In contrast, Heligmosomoides polygyrus caused an expansion of goblet and tuft cell populations. Our survey highlights new markers and programs, associates sensory molecules to cell types, and uncovers principles of gut homeostasis and response to pathogens.
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影响因子：
64.8
作者：
Gerbe F;Sidot E;Smyth DJ;Ohmoto M;Matsumoto I;Dardalhon V;Cesses P;Garnier L;Pouzolles M;Brulin B;Bruschi M;Harcus Y;Zimmermann VS;Taylor N;Maizels RM;Jay P
通讯作者：
Jay P
影响因子：
2.5
作者：
Bezencon, C.;Fuerholz, A.;Damak, S.
通讯作者：
Damak, S.
影响因子：
5.3
作者：
de Lau, Wim;Kujala, Pekka;Clevers, Hans
通讯作者：
Clevers, Hans
簇细胞，味觉化学细胞，在肠道中编排寄生虫2型免疫力。
DOI：
10.1126/science.aaf1648
发表时间：
2016-03-18
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Howitt MR;Lavoie S;Michaud M;Blum AM;Tran SV;Weinstock JV;Gallini CA;Redding K;Margolskee RF;Osborne LC;Artis D;Garrett WS
通讯作者：
Garrett WS
DOI：
10.1111/j.2517-6161.1995.tb02031.x
发表时间：
1995-01-01
影响因子：
5.8
作者：
BENJAMINI, Y;HOCHBERG, Y
通讯作者：
HOCHBERG, Y