The Xist lncRNA exploits three-dimensional genome architecture to spread across the X chromosome.
The Xist lncRNA exploits three-dimensional genome architecture to spread across the X chromosome.
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DOI：
10.1126/science.1237973
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发表时间：
2013-08-16
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Guttman M
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Engreitz JM;Pandya-Jones A;McDonel P;Shishkin A;Sirokman K;Surka C;Kadri S;Xing J;Goren A;Lander ES;Plath K;Guttman M
许多大的非编码RNA(LncRNAs)调节染色质，但它们定位于基因组靶标的机制仍未被探索。在这里，我们研究了Xist lncRNA在X染色体失活(XCI)过程中的定位机制，XCI是一种由lncRNA介导的染色质调节范例。在XCI的维持过程中，Xist广泛地结合在X染色体上。在XCI的启动过程中，Xist最初转移到X染色体上不是由特定序列定义的远端区域。相反，Xist通过利用X染色体的三维构象来识别这些区域。XIST需要它的沉默结构域扩散到活跃转录的区域，从而访问整个染色体。这提出了一种模型，在该模型中，Xist通过在三维中搜索、修改染色体结构并传播到新的可访问位置来覆盖X染色体。
Many large noncoding RNAs (lncRNAs) regulate chromatin, but the mechanisms by which they localize to genomic targets remain unexplored. Here we investigate the localization mechanisms of the Xist lncRNA during X-chromosome inactivation (XCI), a paradigm of lncRNA-mediated chromatin regulation. During the maintenance of XCI, Xist binds broadly across the X-chromosome. During initiation of XCI, Xist initially transfers to distal regions across the X-chromosome that are not defined by specific sequences. Instead, Xist identifies these regions by exploiting the three-dimensional conformation of the X-chromosome. Xist requires its silencing domain to spread across actively transcribed regions and thereby access the entire chromosome. This suggests a model where Xist coats the X-chromosome by searching in three dimensions, modifying chromosome structure, and spreading to newly accessible locations.
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影响因子：
56.9
作者：
Carninci, P;Kasukawa, T;Hayashizaki, Y
通讯作者：
Hayashizaki, Y
DOI：
10.1038/nrg3454
发表时间：
2013-06
期刊：
Nature reviews. Genetics
影响因子：
--
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
10.5
作者：
Cabili, Moran N.;Trapnell, Cole;Rinn, John L.
通讯作者：
Rinn, John L.
影响因子：
7.8
作者：
Clemson, CM;McNeil, JA;Willard, HF;Lawrence, JB
通讯作者：
Lawrence, JB
影响因子：
46.9
作者：
通讯作者：
--