Discovery of Nucleic Acid Binding Molecules from Combinatorial Biohybrid Nucleobase Peptide Libraries.
Discovery of Nucleic Acid Binding Molecules from Combinatorial Biohybrid Nucleobase Peptide Libraries.
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DOI：
10.1021/jacs.0c08964
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发表时间：
2020-11-18
影响因子：
15
通讯作者：
Pentelute BL
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Pomplun S;Gates ZP;Zhang G;Quartararo AJ;Pentelute BL
自然界有三种生物聚合物：寡核苷酸、多肽和寡糖。每种生物聚合物都有独立的功能，但在需要时，它们会形成混合的组装体用于更高层次的目的，就像核糖体蛋白质合成的情况一样。我们不是形成大的复合物来协调不同生物聚合物的作用，而是将蛋白质氨基酸和核碱基拼接成单一的低分子量精密聚酰胺聚合物。我们建立了高效的化学合成和从头测序程序，并制备了多达1亿个生物杂交分子的组合文库。这种生物杂交材料对寡核苷酸具有比仅由典型氨基酸组成的肽更高的整体亲和力。使用亲和力选择质谱法，我们发现了对前microRNA发夹具有高亲和力的变体。我们的平台指向高通量发现具有设计师特性（如寡核苷酸结合）的序列定义聚合物的发展。
Nature has three biopolymers: oligonucleotides, polypeptides, and oligosaccharides. Each biopolymer has independent functions, but when needed, they form mixed assemblies for higher-order purposes, as in the case of ribosomal protein synthesis. Rather than forming large complexes to coordinate the role of different biopolymers, we dovetail protein amino acids and nucleobases into a single low molecular weight precision polyamide polymer. We established efficient chemical synthesis and de novo sequencing procedures and prepared combinatorial libraries with up to 100 million biohybrid molecules. This biohybrid material has a higher bulk affinity to oligonucleotides than peptides composed exclusively of canonical amino acids. Using affinity selection mass spectrometry, we discovered variants with a high affinity for pre-microRNA hairpins. Our platform points toward the development of high throughput discovery of sequence defined polymers with designer properties, such as oligonucleotide binding.
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影响因子：
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作者：
Chen Z;Lichtor PA;Berliner AP;Chen JC;Liu DR
通讯作者：
Liu DR
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