Small-molecule-mediated G-quadruplex isolation from human cells.
Small-molecule-mediated G-quadruplex isolation from human cells.
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DOI：
10.1038/nchem.842
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发表时间：
2010-12
期刊：
影响因子：
21.8
通讯作者：
Balasubramanian, Shankar
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Mueller, Sebastian;Kumari, Sunita;Rodriguez, Raphael;Balasubramanian, Shankar
含有串联鸟嘌呤的核酸可以折叠成称为G-四链体的四链结构。基因组DNA中存在这样的序列表明这些基序在细胞中的存在，在许多与癌症相关的生物过程中具有潜在的意义。小分子已被证明是解剖细胞回路的有价值的工具。在这里，我们描述了一种合成的小分子衍生自N，N '-双（2-喹啉基）吡啶-2，6-二甲酰胺，其被设计为介导G-四链体核酸的选择性分离。该方法被成功地应用到一系列的DNA和RNA的G-四链体在体外。我们证明了该方法的普遍适用性，通过分离端粒DNA含有G-四链体图案从细胞。我们发现端粒是探针的靶点，为人类细胞中G-四链体的形成提供了进一步的证据。
Nucleic acids containing stretches of tandem guanines can fold into four-stranded structures called G-quadruplexes. The existence of such sequences in genomic DNA suggests the occurrence of these motifs in cells, with potential implications in a number of biological processes relevant to cancer. Small molecules have proven to be valuable tools to dissect cell circuitry. Here, we describe a synthetic small molecule derived from an N,N’-bis(2-quinolinyl)pyridine-2,6-dicarboxamide, which is designed to mediate the selective isolation of G-quadruplex nucleic acids. The methodology was successfully applied to a range of DNA and RNA G-quadruplexes in vitro. We demonstrate the general applicability of the method by isolating telomeric DNA-containing G-quadruplex motifs from cells. We show that telomeres are targets for the probe, providing further evidence of the formation of G-quadruplexes in human cells.
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影响因子：
3.2
作者：
Bugaut A;Rodriguez R;Kumari S;Hsu ST;Balasubramanian S
通讯作者：
Balasubramanian S
影响因子：
11.4
作者：
Schaeffer, C;Bardoni, B;Moine, H
通讯作者：
Moine, H
影响因子：
14.9
作者：
Cawthon, RM
通讯作者：
Cawthon, RM
影响因子：
15
作者：
HUNTER, CA;SANDERS, JKM
通讯作者：
SANDERS, JKM
DOI：
10.1039/b816861j
发表时间：
2009-01-07
期刊：
Chemical communications (Cambridge, England)
影响因子：
--
作者：
Müller S;Pantoş GD;Rodriguez R;Balasubramanian S
通讯作者：
Balasubramanian S