Hot spots for allosteric regulation on protein surfaces.
Hot spots for allosteric regulation on protein surfaces.
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DOI：
10.1016/j.cell.2011.10.049
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发表时间：
2011-12-23
期刊：
影响因子：
64.5
通讯作者：
Ranganathan R
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Reynolds KA;McLaughlin RN;Ranganathan R
最近的工作表明，蛋白质的一般结构，其中物理上连续和共同进化的氨基酸的稀疏网络构成了结构和功能的基本方面。这些网络，被称为扇区，在空间上组织，使活跃的网站链接到许多表面网站分布在整个结构。使用代谢酶二氢叶酸还原酶作为模型系统，我们表明，（1）该部门是强烈相关的网络的残基经历毫秒构象波动与酶催化和（2）部门连接的表面网站是统计学上的首选位置出现变构控制在体内。因此，扇区代表了一种进化上保守的“布线”机制，可以使特定表面位置的扰动快速启动对蛋白质功能的构象控制。这些发现表明，部门使分子间的通信和调节的演变。
Recent work indicates a general architecture for proteins in which sparse networks of physically contiguous and co-evolving amino acids underlie basic aspects of structure and function. These networks, termed sectors, are spatially organized such that active sites are linked to many surface sites distributed throughout the structure. Using the metabolic enzyme dihydrofolate reductase as a model system, we show that (1) the sector is strongly correlated to a network of residues undergoing millisecond conformational fluctuations associated with enzyme catalysis and (2) sector-connected surface sites are statistically preferred locations for the emergence of allosteric control in vivo. Thus, sectors represent an evolutionarily conserved “wiring” mechanism that can enable perturbations at specific surface positions to rapidly initiate conformational control over protein function. These findings suggest that sectors enable the evolution of intermolecular communication and regulation.
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DOI：
10.1126/science.1198542
发表时间：
2011-04-08
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Bhabha G;Lee J;Ekiert DC;Gam J;Wilson IA;Dyson HJ;Benkovic SJ;Wright PE
通讯作者：
Wright PE
电压传感器和孔之间需要两个独立的接口来实现电压依赖性 K(+) 通道的功能。
影响因子：
9.8
作者：
Lee, Seok-Yong;Banerjee, Anirban;MacKinnon, Roderick
通讯作者：
MacKinnon, Roderick
DOI：
10.1126/science.1159052
发表时间：
2008-10-17
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Lee J;Natarajan M;Nashine VC;Socolich M;Vo T;Russ WP;Benkovic SJ;Ranganathan R
通讯作者：
Ranganathan R
影响因子：
56.9
作者：
Boehr, David D.;McElheny, Dan;Wright, Peter E.
通讯作者：
Wright, Peter E.
影响因子：
64.8
作者：
Eisenmesser, EZ;Millet, O;Kern, D
通讯作者：
Kern, D