Epiviz: interactive visual analytics for functional genomics data.
Epiviz: interactive visual analytics for functional genomics data.
复制标题
DOI：
10.1038/nmeth.3038
复制
发表时间：
2014-09
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Bravol, Hector Corrada
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Chelaru, Florin;Smith, Llewellyn;Goldstein, Naomi;Bravol, Hector Corrada
可视化是基因组学数据分析的一个组成部分，其中在Bioconductor等计算环境中执行的程序的输出通常是可视化的。数学统计分析和交互式可视化通常是不相交的，但在迭代使用时最有效。我们介绍了提供这种紧密结合的集成工具：Epiviz（epiviz.cbcb.umd.edu），一个基于Web的基因组浏览器，和Epivizr Bioconductor包，允许在最先进的数据分析平台内进行交互式，可扩展和可再现的可视化。
Visualization is an integral aspect of genomics data analysis where the output of procedures performed in computing environments like Bioconductor is often visualized. Algorithmic-statistical analysis and interactive visualization are usually disjoint but are most effective when used iteratively. We introduce tools that provide this tight-knit integration: Epiviz (http://epiviz.cbcb.umd.edu), a web-based genome browser, and the Epivizr Bioconductor package allowing interactive, extensible and reproducible visualization within a state-of-the-art data analysis platform.
登录
查看更多内容
影响因子：
4.4
作者：
Goecks J;Eberhard C;Too T;Galaxy Team;Nekrutenko A;Taylor J
通讯作者：
Taylor J
影响因子：
12.3
作者：
Gentleman RC;Carey VJ;Bates DM;Bolstad B;Dettling M;Dudoit S;Ellis B;Gautier L;Ge Y;Gentry J;Hornik K;Hothorn T;Huber W;Iacus S;Irizarry R;Leisch F;Li C;Maechler M;Rossini AJ;Sawitzki G;Smith C;Smyth G;Tierney L;Yang JY;Zhang J
通讯作者：
Zhang J
影响因子：
5.8
作者：
Miller, Chase A.;Anthony, Jon;Marth, Gabor
通讯作者：
Marth, Gabor
影响因子：
5.8
作者：
Aryee, Martin J.;Jaffe, Andrew E.;Irizarry, Rafael A.
通讯作者：
Irizarry, Rafael A.
DOI：
10.1109/tvcg.2011.185
发表时间：
2011-12-01
影响因子：
5.2
作者：
Bostock, Michael;Ogievetsky, Vadim;Heer, Jeffrey
通讯作者：
Heer, Jeffrey