Massively parallel single-nucleus RNA-seq with DroNc-seq.
Massively parallel single-nucleus RNA-seq with DroNc-seq.
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DOI：
10.1038/nmeth.4407
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发表时间：
2017-10
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Regev A
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Habib N;Avraham-Davidi I;Basu A;Burks T;Shekhar K;Hofree M;Choudhury SR;Aguet F;Gelfand E;Ardlie K;Weitz DA;Rozenblatt-Rosen O;Zhang F;Regev A
单核RNA-seq（sNuc-seq）分析来自保存或不能解离的组织的RNA，但不提供分析来自复杂组织的许多细胞所需的通量。在这里，我们开发了DroNc-seq，这是一种使用液滴技术的大规模并行sNuc-Seq。我们分析了来自小鼠和人类存档大脑样本的39，111个细胞核，以证明细胞类型的敏感，有效和无偏见的分类，为细胞图谱的系统制图铺平了道路。
Single nucleus RNA-seq (sNuc-seq) profiles RNA from tissues that are preserved or cannot be dissociated, but does not provide the throughput required to analyse many cells from complex tissues. Here, we develop DroNc-seq, massively parallel sNuc-Seq with droplet technology. We profile 39,111 nuclei from mouse and human archived brain samples to demonstrate sensitive, efficient and unbiased classification of cell types, paving the way for systematic charting of cell atlases.
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DOI：
10.1126/science.aad0501
发表时间：
2016-04-08
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Tirosh I;Izar B;Prakadan SM;Wadsworth MH 2nd;Treacy D;Trombetta JJ;Rotem A;Rodman C;Lian C;Murphy G;Fallahi-Sichani M;Dutton-Regester K;Lin JR;Cohen O;Shah P;Lu D;Genshaft AS;Hughes TK;Ziegler CG;Kazer SW;Gaillard A;Kolb KE;Villani AC;Johannessen CM;Andreev AY;Van Allen EM;Bertagnolli M;Sorger PK;Sullivan RJ;Flaherty KT;Frederick DT;Jané-Valbuena J;Yoon CH;Rozenblatt-Rosen O;Shalek AK;Regev A;Garraway LA
通讯作者：
Garraway LA
影响因子：
46.9
作者：
Wagner A;Regev A;Yosef N
通讯作者：
Yosef N
DOI：
10.1126/science.1262110
发表时间：
2015-05-08
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
GTEx Consortium
通讯作者：
GTEx Consortium
影响因子：
64.5
作者：
Dixit, Atray;Pamas, Oren;Li, Biyu;Chen, Jenny;Fulco, Charles P.;Jerby-Amon, Livnat;Marjanovic, Nemanja D.;Dionne, Danielle;Burks, Tyler;Raychowdhury, Raktima;Adamson, Britt;Norman, Thomas M.;Lander, Eric S.;Weissman, Jonathan S.;Friedman, Nir;Regev, Aviv
通讯作者：
Regev, Aviv
影响因子：
64.5
作者：
Rabani M;Raychowdhury R;Jovanovic M;Rooney M;Stumpo DJ;Pauli A;Hacohen N;Schier AF;Blackshear PJ;Friedman N;Amit I;Regev A
通讯作者：
Regev A