Single-Cell Resolution of Temporal Gene Expression during Heart Development.
Single-Cell Resolution of Temporal Gene Expression during Heart Development.
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DOI：
10.1016/j.devcel.2016.10.001
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发表时间：
2016-11-21
影响因子：
11.8
通讯作者：
Seidman, Christine E.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
DeLaughter, Daniel M.;Bick, Alexander G.;Wakimoto, Hiroko;McKean, David;Gorham, Joshua M.;Kathiriya, Irian S.;Hinson, John T.;Homsy, Jason;Gray, Jesse;Pu, William;Bruneau, Benoit G.;Seidman, J. G.;Seidman, Christine E.
特定细胞谱系中复杂分子程序的激活控制着哺乳动物心脏的发育，从原始的线性管到四腔器官。为了表征谱系特异性的时空发育程序，我们对在E9.5（原始心管）至P21（成熟心脏）的七个时间点分离的>1200个鼠细胞进行单细胞RNA测序。使用无偏的转录数据，我们分类心肌细胞（CM），内皮细胞（EC），和成纤维细胞富集的细胞，从而确定标记的时间和室特异性的发展计划。利用这些数据集，我们定义了人类和小鼠多能干细胞衍生CM的发育年龄，并表征了Nkx2.5杂合突变导致人类心脏畸形的小鼠心脏中的谱系特异性成熟缺陷。这种心脏发育的时空转录组分析揭示了正常心脏发育和先天性心脏病背后的谱系特异性基因程序。
Activation of complex molecular programs in specific cell lineages governs mammalian heart development, from a primordial linear tube to a four-chamber organ. To characterize lineage-specific, temporal-spatial developmental programs, we performed single-cell RNA sequencing of >1200 murine cells isolated at seven time points spanning E9.5 (primordial heart tube) to P21 (mature heart). Using unbiased transcriptional data we classified cardiomyocytes (CM), endothelial cells (EC), and fibroblast-enriched cells, thus identifying markers for temporal and chamber-specific developmental programs. Harnessing these datasets, we defined developmental ages of human and mouse pluripotent stem cell-derived CMs and characterized lineage-specific maturation defects in hearts of mice with heterozygous mutations in Nkx2.5 that cause human heart malformations. This spatial-temporal transcriptome analysis of heart development reveals lineage-specific gene programs underlying normal cardiac development and congenital heart disease.
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雏鸡和小鼠心内膜垫的空间转录曲线在体外鉴定了内膜EMT的新调节剂。
影响因子：
5
作者：
DeLaughter DM;Christodoulou DC;Robinson JY;Seidman CE;Baldwin HS;Seidman JG;Barnett JV
通讯作者：
Barnett JV
DOI：
10.1016/j.bbrc.2007.08.186
发表时间：
2007-11-16
影响因子：
3.1
作者：
Koo, Jae Hyung;Smiley, Mark A.;Margolis, Frank L.
通讯作者：
Margolis, Frank L.
DOI：
10.1126/science.1214977
发表时间：
2012-05-18
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Bick AG;Calvo SE;Mootha VK
通讯作者：
Mootha VK
影响因子：
4
作者：
Cheroki, C.;Krepischi-Santos, A. C. V.;Rosenberg, C.
通讯作者：
Rosenberg, C.
影响因子：
5
作者：
Liang, Bo;Soka, Magdalena;Fatkin, Diane
通讯作者：
Fatkin, Diane