Global mapping of the topography and magnitude of proteolytic events in apoptosis.
Global mapping of the topography and magnitude of proteolytic events in apoptosis.
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DOI：
10.1016/j.cell.2008.06.038
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发表时间：
2008-08-22
期刊：
影响因子：
64.5
通讯作者：
Cravatt BF
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Dix MM;Simon GM;Cravatt BF
蛋白水解是促进蛋白激活、易位和/或降解的关键调控过程。因此，人们对全面表征生物系统中蛋白质水解途径的方法非常感兴趣。在这里，我们描述了一个强大的和通用的蛋白质组学平台，可以在全球范围内直接可视化蛋白质水解事件的地形和大小。我们使用这种方法生成由内在凋亡途径诱导的蛋白水解事件的蛋白质组范围图。该图谱包含91个表征的caspase底物以及170个以前不知道在细胞凋亡过程中被切割的额外蛋白质。令人惊讶的是，绝大多数蛋白水解蛋白，无论切割程度如何，都会产生与离散蛋白结构域相对应的持久片段，这表明活性效应蛋白的产生可能是凋亡蛋白水解级联反应的主要功能。
Proteolysis is a key regulatory process that promotes the (in)activation, translocation, and/or degradation of proteins. As such, there is considerable interest in methods to comprehensively characterize proteolytic pathways in biological systems. Here, we describe a robust and versatile proteomic platform that enables direct visualization of the topography and magnitude of proteolytic events on a global scale. We use this method to generate a proteome-wide map of proteolytic events induced by the intrinsic apoptotic pathway. This profile contained 91 characterized caspase substrates as well as 170 additional proteins not previously known to be cleaved during apoptosis. Surprisingly, the vast majority of proteolyzed proteins, regardless of the extent of cleavage, yielded persistent fragments that correspond to discrete protein domains, suggesting that the generation of active effector proteins may be a principal function of apoptotic proteolytic cascades.
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Graves, JD;Gotoh, Y;Krebs, EG
通讯作者：
Krebs, EG
DOI：
10.1152/ajpgi.00467.2001
发表时间：
2002-05-01
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Feng, GP;Kaplowitz, N
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