Altered DNA repair creates novel Alu/Alu repeat-mediated deletions.
Altered DNA repair creates novel Alu/Alu repeat-mediated deletions.
复制标题
改变的DNA修复会产生新型的ALU/ALU重复介导的缺失。
DOI：
10.1002/humu.24193
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发表时间：
2021-05
期刊：
影响因子：
3.9
通讯作者：
Deininger P
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Morales ME;Kaul T;Walker J;Everett C;White T;Deininger P
Alu元素是影响人类基因组遗传不稳定性的最丰富的非等位基因同源性来源。当DNA双链断裂时，Alu元件的高拷贝数、中等长度和距离以及元件之间的不匹配对重组过程产生独特的影响。我们利用报告基因分析来显示Alu错配对Alu相关重复介导缺失（RMDs）的复杂影响。Alu/Alu异双工中间体可导致非等位基因同源重组（HR）。或者，异双工可以导致由竞争核酸酶引起的Alu元件周围的各种DNA断裂。这些断裂可以发生Alt -非同源末端连接，导致Alu元件周围的缺失。这些异双相中间体的形成很大程度上依赖于RAD52。ERCC1水平较低的细胞更多地利用这些替代分辨率，而具有MSH2缺陷的细胞往往具有更多的rmd，并且HR事件的特异性增加。因此，根据这些DNA修复缺陷的数量，Alu元素有望在各种癌症中产生不同形式的缺失。
Alu elements are the most abundant source of nonallelic homology that influences genetic instability in the human genome. When there is a DNA double‐stranded break, the Alu element's high copy number, moderate length and distance and mismatch between elements uniquely influence recombination processes. We utilize a reporter‐gene assay to show the complex influence of Alu mismatches on Alu‐related repeat‐mediated deletions (RMDs). The Alu/Alu heteroduplex intermediate can result in a nonallelic homologous recombination (HR). Alternatively, the heteroduplex can result in various DNA breaks around the Alu elements caused by competing nucleases. These breaks can undergo Alt‐nonhomologous end joining to cause deletions focused around the Alu elements. Formation of these heteroduplex intermediates is largely RAD52 dependent. Cells with low ERCC1 levels utilize more of these alternatives resolutions, while cells with MSH2 defects tend to have more RMDs with a specific increase in the HR events. Therefore, Alu elements are expected to create different forms of deletions in various cancers depending on a number of these DNA repair defects.
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