Flapjack--graphical genotype visualization.
Flapjack--graphical genotype visualization.
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btq580
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发表时间：
2010-12-15
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Marshall D
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Milne I;Shaw P;Stephen G;Bayer M;Cardle L;Thomas WT;Flavell AJ;Marshall D
总结：需要用于图形基因分型的新软件工具，其可以常规地处理由高通量单核苷酸多态性（SNP）平台、测序基因分型和其他可比基因分型技术产生的大量数据。Flapjack已经被开发来促进这些数据的分析，提供具有快速导航和线、标记和染色体之间的比较的真实的时间渲染，具有基于相关数据（诸如表型、数量性状基因座或其他可映射特征）的可视化、排序和查询。可用性：Flapjack可免费用于Microsoft Windows、Mac OS X、Linux和Solaris，并可从http://bioinf.scri.ac.uk/flapjack下载联系方式：flapjack@scri.ac.uk
Summary: New software tools for graphical genotyping are required that can routinely handle the large data volumes generated by the high-throughput single-nucleotide polymorphism (SNP) platforms, genotyping-by-sequencing and other comparable genotyping technologies. Flapjack has been developed to facilitate analysis of these data, providing real time rendering with rapid navigation and comparisons between lines, markers and chromosomes, with visualization, sorting and querying based on associated data, such as phenotypes, quantitative trait loci or other mappable features. Availability: Flapjack is freely available for Microsoft Windows, Mac OS X, Linux and Solaris, and can be downloaded from http://bioinf.scri.ac.uk/flapjack Contact: flapjack@scri.ac.uk
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通讯作者：
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van Berloo, Ralph
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通讯作者：
Stein, Lincoln
DOI：
10.1073/pnas.0606133103
发表时间：
2006-12-05
影响因子：
11.1
作者：
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通讯作者：
Waugh, Robbie