Uberon, an integrative multi-species anatomy ontology.
Uberon, an integrative multi-species anatomy ontology.
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DOI：
10.1186/gb-2012-13-1-r5
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发表时间：
2012-01-31
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
Haendel MA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Mungall CJ;Torniai C;Gkoutos GV;Lewis SE;Haendel MA
我们提出了Uberon，一个综合的跨物种本体论，包括6,500多个类，代表各种解剖实体，根据传统的解剖分类标准组织。该本体以物种中立的方式表示结构，并包括与现有的以物种为中心的解剖本体的广泛关联，允许模型生物和人类数据的集成。Uberon在不同类群的解剖结构之间提供了一个必要的桥梁，用于跨种推断。它使用新的方法来表示分类变异，并已被证明是必不可少的翻译表型分析。Uberon可在http://uberon.org上获得
We present Uberon, an integrated cross-species ontology consisting of over 6,500 classes representing a variety of anatomical entities, organized according to traditional anatomical classification criteria. The ontology represents structures in a species-neutral way and includes extensive associations to existing species-centric anatomical ontologies, allowing integration of model organism and human data. Uberon provides a necessary bridge between anatomical structures in different taxa for cross-species inference. It uses novel methods for representing taxonomic variation, and has proved to be essential for translational phenotype analyses. Uberon is available at http://uberon.org
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影响因子：
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作者：
Swart EC;Hide WA;Seoighe C
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Seoighe C
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Mungall, Christopher J.