NMR chemical shift assignments of RNA oligonucleotides to expand the RNA chemical shift database
NMR chemical shift assignments of RNA oligonucleotides to expand the RNA chemical shift database
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RNA 寡核苷酸的 NMR 化学位移分配以扩展 RNA 化学位移数据库
DOI：
10.1007/s12104-021-10049-0
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发表时间：
2021
影响因子：
0.9
通讯作者：
Morgenstern, Nicholas W.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Liu, Yaping;Kotar, Anita;Hodges, Tracy L.;Abdallah, Kyrillos;Taleb, Mallak H.;Bitterman, Brayden A.;Jaime, Sara;Schaubroeck, Kyle J.;Mathew, Ethan;Morgenstern, Nicholas W.
RNA在细胞中发挥着无数的功能和调节作用。尽管它们的重要性，RNA分子的三维结构解析显着落后于蛋白质。基于NMR的研究通常受到化学位移分配的速率限制。化学位移赋值过程的自动化可以极大地促进结构研究，然而，准确的化学位移预测依赖于一个强大而完整的化学位移数据库进行训练。我们检索了生物磁共振数据库（BMRB），以确定没有（或有限）化学位移信息的序列。在这里，我们报告了12个RNA发夹的化学位移分配，这些发夹是专门设计来帮助填充BMRB的。
RNAs play myriad functional and regulatory roles in the cell. Despite their significance, three-dimensional structure elucidation of RNA molecules lags significantly behind that of proteins. NMR-based studies are often rate-limited by the assignment of chemical shifts. Automation of the chemical shift assignment process can greatly facilitate structural studies, however, accurate chemical shift predictions rely on a robust and complete chemical shift database for training. We searched the Biological Magnetic Resonance Data Bank (BMRB) to identify sequences that had no (or limited) chemical shift information. Here, we report the chemical shift assignments for 12 RNA hairpins designed specifically to help populate the BMRB.
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B-DNA 中 C·C 错配的 NMR 质子化学位移预测。
DOI：
--
发表时间：
2015
期刊：
Journal of magnetic resonance (San Diego, Calif. 1997 : Print)
影响因子：
--
作者：
K. S. Ng;S. L. Lam
通讯作者：
S. L. Lam
DOI：
--
发表时间：
2014-09
期刊：
arXiv: Chemical Physics
影响因子：
--
作者：
A. S. Larsen
通讯作者：
A. S. Larsen
影响因子：
--
作者：
Burnett JC;Rossi JJ
通讯作者：
Rossi JJ
铅依赖性核酶的顺序、动力学和金属结合。
影响因子：
5.6
作者：
P. Legault;C. G. Hoogstraten;E. Metlitzky;A. Pardi
通讯作者：
A. Pardi
影响因子：
2.7
作者：
JOHNSON, BA;BLEVINS, RA
通讯作者：
BLEVINS, RA