A novel informatics concept for high-throughput shotgun lipidomics based on the molecular fragmentation query language.
A novel informatics concept for high-throughput shotgun lipidomics based on the molecular fragmentation query language.
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DOI：
10.1186/gb-2011-12-1-r8
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发表时间：
2011
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
Shevchenko A
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Herzog R;Schwudke D;Schuhmann K;Sampaio JL;Bornstein SR;Schroeder M;Shevchenko A
鸟枪式脂质体谱分析依赖于对细胞、组织或生物体总脂类提取物的直接质谱分析，是阐明脂体分子组成的有力工具。我们提出了在LipidXplorer开源软件套件中实现的分子碎片查询语言的新信息学概念，该语言支持在任何质谱学平台上获取的猎枪光谱中任何可电离脂质类别的单个物种的准确量化。
Shotgun lipidome profiling relies on direct mass spectrometric analysis of total lipid extracts from cells, tissues or organisms and is a powerful tool to elucidate the molecular composition of lipidomes. We present a novel informatics concept of the molecular fragmentation query language implemented within the LipidXplorer open source software kit that supports accurate quantification of individual species of any ionizable lipid class in shotgun spectra acquired on any mass spectrometry platform.
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DOI：
10.1016/j.jasms.2005.11.003
发表时间：
2006-02-01
影响因子：
3.2
作者：
Han, XL;Yang, K;Gross, RW
通讯作者：
Gross, RW
影响因子：
2
作者：
Oursel, Delphine;Loutelier-Bourhis, Corinne;Lange, Catherine M.
通讯作者：
Lange, Catherine M.
影响因子：
7.4
作者：
Ekroos, K;Chernushevich, IV;Shevchenko, A
通讯作者：
Shevchenko, A
影响因子：
4.6
作者：
Carvalho, Maria;Schwudke, Dominik;Eaton, Suzanne
通讯作者：
Eaton, Suzanne
影响因子：
2.3
作者：
Huebner, Goeran;Crone, Catharina;Lindner, Buko
通讯作者：
Lindner, Buko