Inverted repeat Alu elements in the human lincRNA-p21 adopt a conserved secondary structure that regulates RNA function.
Inverted repeat Alu elements in the human lincRNA-p21 adopt a conserved secondary structure that regulates RNA function.
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DOI：
10.1093/nar/gkw599
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发表时间：
2016-11-02
影响因子：
14.9
通讯作者：
Pyle AM
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Chillón I;Pyle AM
LincRNA-p21 是一种长基因间非编码 RNA (lincRNA)，参与 p53 介导的应激反应。我们对人类 lincRNA-p21 (hLincRNA-p21) 进行了测序，发现它有一个包含反向重复 Alu 元件 (IRAlus) 的外显子。正义和反义 Alu 元件彼此独立地折叠成灵长类动物 lincRNA-p21 中保守的二级结构。此外，IRAlus 形成的结构参与 hLincRNA-p21 在细胞核中的定位，其中 hLincRNA-p21 与 paraspeckles 共定位。我们的结果强调了 IRAlus 结构对于应激反应期间 hLincRNA-p21 功能的重要性。
LincRNA-p21 is a long intergenic non-coding RNA (lincRNA) involved in the p53-mediated stress response. We sequenced the human lincRNA-p21 (hLincRNA-p21) and found that it has a single exon that includes inverted repeat Alu elements (IRAlus). Sense and antisense Alu elements fold independently of one another into a secondary structure that is conserved in lincRNA-p21 among primates. Moreover, the structures formed by IRAlus are involved in the localization of hLincRNA-p21 in the nucleus, where hLincRNA-p21 colocalizes with paraspeckles. Our results underscore the importance of IRAlus structures for the function of hLincRNA-p21 during the stress response.
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影响因子：
64.5
作者：
Huarte M;Guttman M;Feldser D;Garber M;Koziol MJ;Kenzelmann-Broz D;Khalil AM;Zuk O;Amit I;Rabani M;Attardi LD;Regev A;Lander ES;Jacks T;Rinn JL
通讯作者：
Rinn JL
影响因子：
4.5
作者：
Kapusta A;Kronenberg Z;Lynch VJ;Zhuo X;Ramsay L;Bourque G;Yandell M;Feschotte C
通讯作者：
Feschotte C
DOI：
10.1093/bioinformatics/btr209
发表时间：
2011-07-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Lin MF;Jungreis I;Kellis M
通讯作者：
Kellis M
影响因子：
3.4
作者：
Costes, SV;Daelemans, D;Lockett, S
通讯作者：
Lockett, S
影响因子：
3.3
作者：
Fox, AH;Bond, CS;Lamond, AI
通讯作者：
Lamond, AI