Lipid interaction sites on channels, transporters and receptors: Recent insights from molecular dynamics simulations.
Lipid interaction sites on channels, transporters and receptors: Recent insights from molecular dynamics simulations.
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DOI：
10.1016/j.bbamem.2016.02.037
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发表时间：
2016-10
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Sansom MSP
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Hedger G;Sansom MSP
脂质分子能够选择性地与膜蛋白上的特定位点相互作用，并调节其结构和功能。识别和表征这些网站是重要的，我们了解膜蛋白的功能和稳定性的分子基础，并可能有助于设计脂质样药物分子。分子动力学模拟提供了一个强大的工具，这些网站的识别，补充膜蛋白结构生物学和生物物理学的进展。我们描述了最近值得注意的生物分子模拟研究，确定了一系列不同的膜蛋白的脂质相互作用位点。在这些模拟研究中确定的网站同意与互补的实验技术所确定的。这表明了分子动力学方法在预测和表征脂质相互作用位点上的完整膜蛋白的力量。
Lipid molecules are able to selectively interact with specific sites on integral membrane proteins, and modulate their structure and function. Identification and characterisation of these sites is of importance for our understanding of the molecular basis of membrane protein function and stability, and may facilitate the design of lipid-like drug molecules. Molecular dynamics simulations provide a powerful tool for the identification of these sites, complementing advances in membrane protein structural biology and biophysics. We describe recent notable biomolecular simulation studies which have identified lipid interaction sites on a range of different membrane proteins. The sites identified in these simulation studies agree well with those identified by complementary experimental techniques. This demonstrates the power of the molecular dynamics approach in the prediction and characterization of lipid interaction sites on integral membrane proteins.
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