The Sequence Alignment/Map format and SAMtools.
The Sequence Alignment/Map format and SAMtools.
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btp352
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发表时间：
2009-08-15
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
1000 Genome Project Data Processing Subgroup
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Li H;Handsaker B;Wysoker A;Fennell T;Ruan J;Homer N;Marth G;Abecasis G;Durbin R;1000 Genome Project Data Processing Subgroup
摘要：序列对齐/地图（SAM）格式是一种用于对参考序列进行读取比对的通用对齐格式，支持不同的测序平台产生的简短和长读（最高128 MBP）。它的样式灵活，大小紧凑，随机访问有效，是释放1000个基因组项目对齐的格式。 Samtools实现了各种实用程序，用于以SAM格式进行后处理对齐，例如索引，变体呼叫者和对齐查看器，因此提供了用于处理读取对齐的通用工具。
可用性：http：//samtools.sourceforge.net
联系人：rd@sanger.ac.uk
Summary: The Sequence Alignment/Map (SAM) format is a generic alignment format for storing read alignments against reference sequences, supporting short and long reads (up to 128 Mbp) produced by different sequencing platforms. It is flexible in style, compact in size, efficient in random access and is the format in which alignments from the 1000 Genomes Project are released. SAMtools implements various utilities for post-processing alignments in the SAM format, such as indexing, variant caller and alignment viewer, and thus provides universal tools for processing read alignments. Availability: http://samtools.sourceforge.net Contact: rd@sanger.ac.uk
影响因子：
7
作者：
Li, Heng;Ruan, Jue;Durbin, Richard
通讯作者：
Durbin, Richard
影响因子：
12.3
作者：
Langmead B;Trapnell C;Pop M;Salzberg SL
通讯作者：
Salzberg SL
影响因子：
7
作者：
Kent, WJ;Sugnet, CW;Haussler, D
通讯作者：
Haussler, D