Core promoters are predicted by their distinct physicochemical properties in the genome of Plasmodium falciparum.
Core promoters are predicted by their distinct physicochemical properties in the genome of Plasmodium falciparum.
复制标题
DOI：
10.1186/gb-2008-9-12-r178
复制
发表时间：
2008
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
Pizzi, Elisabetta
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Brick, Kevin;Watanabe, Junichi;Pizzi, Elisabetta
提出了一种仅利用DNA物理化学性质计算鉴定恶性疟原虫基因组核心启动子的方法。对恶性疟原虫核心启动子的结构和特征了解甚少。在这项工作中，我们描述了在这个富含at的基因组中计算鉴定核心启动子的第一种方法。该预测算法仅使用DNA的物理化学性质作为描述符。我们的结果增加了越来越多的证据，真核生物基因组的物理化学密码在核心启动子识别中起着至关重要的作用。
A method is presented to computationally identify core promoters in the Plasmodium falciparum genome using only DNA physicochemical properties. Little is known about the structure and distinguishing features of core promoters in Plasmodium falciparum. In this work, we describe the first method to computationally identify core promoters in this AT-rich genome. This prediction algorithm uses solely DNA physicochemical properties as descriptors. Our results add to a growing body of evidence that a physicochemical code for eukaryotic genomes plays a crucial role in core promoter recognition.
登录
查看更多内容
影响因子：
9.8
作者：
Bozdech, Zbynek;Llinas, Manuel;Pulliam, Brian Lee;Wong, Edith D;Zhu, Jingchun;DeRisi, Joseph L
通讯作者：
DeRisi, Joseph L
影响因子：
4.8
作者：
Calderwood, MS;Gannoun-Zaki, L;Deitsch, KW
通讯作者：
Deitsch, KW
影响因子：
46.9
作者：
Bajic, VB;Tan, SL;Sugano, S
通讯作者：
Sugano, S
影响因子：
3.5
作者：
Bultrini, Emanuele;Pizzi, Elisabetta
通讯作者：
Pizzi, Elisabetta
影响因子：
64.8
作者：
Deitsch, KW;Calderwood, MS;Wellems, TE
通讯作者：
Wellems, TE