A role for the cell-wall protein silacidin in cell size of the diatom Thalassiosira pseudonana.
A role for the cell-wall protein silacidin in cell size of the diatom Thalassiosira pseudonana.
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DOI：
10.1038/ismej.2017.100
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发表时间：
2017-11
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Mock T
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kirkham AR;Richthammer P;Schmidt K;Wustmann M;Maeda Y;Hedrich R;Brunner E;Tanaka T;van Pée KH;Falciatore A;Mock T
硅藻占全球初级产量的20%，是许多海洋食物网的基础。尽管它们的物种多样性与细胞大小的广泛多样性有关，但由于有性繁殖和不同的环境条件，种内细胞大小也存在可塑性。然而，尽管硅藻细胞的大小对食物网结构和全球生物地球化学循环具有重要的生态意义，但我们对硅藻细胞大小的基因的了解仍然难以捉摸。在这里，反向遗传学，实验进化和比较rna测序分析的结合使我们能够识别以前未知的硅藻假海硅藻细胞大小的遗传控制。特别是，有针对性地解除细胞壁蛋白硅酸素的表达，导致瓣膜直径显著增加。值得注意的是，低温下实验进化导致硅酸苷基因转录物的自然下调也与细胞大小的增加有关。我们的数据为假单胞藻和其他中心硅藻的细胞大小的遗传控制调控提供了第一个证据，因为它们也在其基因组中编码硅酸素基因。
Diatoms contribute 20% of global primary production and form the basis of many marine food webs. Although their species diversity correlates with broad diversity in cell size, there is also an intraspecific cell-size plasticity owing to sexual reproduction and varying environmental conditions. However, despite the ecological significance of the diatom cell size for food-web structure and global biogeochemical cycles, our knowledge about genes underpinning the size of diatom cells remains elusive. Here, a combination of reverse genetics, experimental evolution and comparative RNA-sequencing analyses enabled us to identify a previously unknown genetic control of cell size in the diatom Thalassiosira pseudonana. In particular, the targeted deregulation of the expression of the cell-wall protein silacidin caused a significant increase in valve diameter. Remarkably, the natural downregulation of the silacidin gene transcript due to experimental evolution under low temperature also correlated with cell-size increase. Our data give first evidence for a genetically controlled regulation of cell size in T. pseudonana and possibly other centric diatoms as they also encode the silacidin gene in their genomes.
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影响因子：
5.1
作者：
Hopes A;Nekrasov V;Kamoun S;Mock T
通讯作者：
Mock T
影响因子：
3.7
作者：
Lavaud J;Materna AC;Sturm S;Vugrinec S;Kroth PG
通讯作者：
Kroth PG
DOI：
10.1073/pnas.0810891106
发表时间：
2009-02-24
影响因子：
11.1
作者：
Litchman, E.;Klausmeier, C. A.;Yoshiyama, K.
通讯作者：
Yoshiyama, K.
影响因子：
3.8
作者：
De Stefano, Luca;Rea, Ilaria;Moretti, Luigi
通讯作者：
Moretti, Luigi
DOI：
10.1111/j.1432-1033.1997.00099.x
发表时间：
1997-11-15
期刊：
EUROPEAN JOURNAL OF BIOCHEMISTRY
影响因子：
--
作者：
Kroger, N;Lehmann, G;Sumper, M
通讯作者：
Sumper, M