Structure of allergens and structure based epitope predictions.
Structure of allergens and structure based epitope predictions.
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DOI：
10.1016/j.ymeth.2013.07.024
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发表时间：
2014-03-01
期刊：
影响因子：
4.8
通讯作者：
Keller, Walter
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Dall'Antonia, Fabio;Pavkov-Keller, Tea;Zangger, Klaus;Keller, Walter
主要过敏原的结构确定是分析过敏原表面暴露区域和绘制构象表位的先决条件。这些可以通过实验方法确定，包括晶体学和基于核磁共振的方法，或通过计算方法预测。本文综述了现有的过敏原结构信息及其在蛋白质折叠家族中的分类。描述了目前可用的过敏原抗体复合物，并比较了实验获得的表位。此外，我们讨论了线性和构象表位定位的既定方法，特别强调了最近开发的一种方法，该方法使用蛋白质的结构相似性结合实验交叉反应性数据进行表位预测。
The structure determination of major allergens is a prerequisite for analyzing surface exposed areas of the allergen and for mapping conformational epitopes. These may be determined by experimental methods including crystallographic and NMR-based approaches or predicted by computational methods. In this review we summarize the existing structural information on allergens and their classification in protein fold families. The currently available allergen-antibody complexes are described and the experimentally obtained epitopes compared. Furthermore we discuss established methods for linear and conformational epitope mapping, putting special emphasis on a recently developed approach, which uses the structural similarity of proteins in combination with the experimental cross-reactivity data for epitope prediction.
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