Global profiling of lysine reactivity and ligandability in the human proteome.
Global profiling of lysine reactivity and ligandability in the human proteome.
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DOI：
10.1038/nchem.2826
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发表时间：
2017-12
期刊：
影响因子：
21.8
通讯作者：
Cravatt BF
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Hacker SM;Backus KM;Lazear MR;Forli S;Correia BE;Cravatt BF
亲核氨基酸对蛋白质功能有重要贡献，包括在催化中发挥关键作用和作为翻译后修饰的位点。靶向氨基酸亲核试剂的亲电基团已被用于产生共价配体和药物，但迄今为止，主要限于半胱氨酸和丝氨酸。在这里，我们报告了一个化学蛋白质组学平台，用于对天然生物系统中的赖氨酸残基进行全球和定量分析。我们总共定量了人类细胞蛋白质组中的9000多个赖氨酸，并鉴定了数百个具有高度反应性的残基，这些残基在蛋白质功能位点富集，并且经常被亲电子小分子靶向。我们发现了赖氨酸反应片段亲电体，通过活性位点和变构机制抑制酶，以及破坏转录调控复合物中的蛋白质-蛋白质相互作用，强调了在整个人类蛋白质组中配体赖氨酸残基的广泛潜力和多样的功能后果。
Nucleophilic amino acids make important contributions to protein function, including performing key roles in catalysis and serving as sites for post-translational modification. Electrophilic groups that target amino-acid nucleophiles have been used to create covalent ligands and drugs, but have, so far, been mainly limited to cysteine and serine. Here we report a chemical proteomic platform for the global and quantitative analysis of lysine residues in native biological systems. We quantified, in total, more than 9000 lysines in human cell proteomes and identified several hundred residues with heightened reactivity that are enriched at protein functional sites and can frequently be targeted by electrophilic small molecules. We discovered lysine-reactive fragment electrophiles that inhibit enzymes by active site and allosteric mechanisms, as well as disrupt protein-protein interactions in transcriptional regulatory complexes, emphasizing the broad potential and diverse functional consequences of liganding lysine residues throughout the human proteome.
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DOI：
10.1016/j.bbagrm.2009.05.007
发表时间：
2009-06
期刊：
Biochimica et biophysica acta
影响因子：
--
作者：
Grzenda A;Lomberk G;Zhang JS;Urrutia R
通讯作者：
Urrutia R
影响因子：
14.8
作者：
Choi S;Connelly S;Reixach N;Wilson IA;Kelly JW
通讯作者：
Kelly JW
DOI：
10.1073/pnas.1413706111
发表时间：
2014-10-14
影响因子：
11.1
作者：
Inloes, Jordon M.;Hsu, Ku-Lung;Cravatt, Benjamin F.
通讯作者：
Cravatt, Benjamin F.
影响因子：
14.8
作者：
Akcay, Gizem;Belmonte, Matthew A.;Su, Qibin
通讯作者：
Su, Qibin
DOI：
10.1073/pnas.97.8.3878
发表时间：
2000-04-11
影响因子：
11.1
作者：
Karlstrom, A;Zhong, GF;Lerner, RA
通讯作者：
Lerner, RA