NPRD: Nucleosome Positioning Region Database.
NPRD: Nucleosome Positioning Region Database.
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DOI：
10.1093/nar/gki049
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发表时间：
2005-01-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Kolchanov NA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Levitsky VG;Katokhin AV;Podkolodnaya OA;Furman DP;Kolchanov NA
核小体定位区域数据库（NPRD）是第一个以核小体形成位点（NFS）为导向的数据库，它汇集了关于NFS位置和特征的实验数据。数据库的对象是单个条目中描述的单个NFS。在对NFS实验定位结果进行注释时，我们特别关注了几个重要的功能特征，如基因活性类型与核小体定位的关系、非组蛋白对核小体形成的影响、核小体定位变异的类型等（平移或旋转），组织类型和细胞活性状态的指示，描述所使用的实验方法和核小体位置测定的准确性，以及将理论和计算机方法应用于上下文和构象DNA特性分析的结果。目前，NPRD数据库包含438个条目，并整合了124篇原始论文中描述的数据。数据库URL：http://srs6.bionet.nsc.ru/srs6/。然后点击按钮“数据库”并打开链接NUCLEOSOME.
Nucleosome Positioning Region Database (NPRD), which is compiling the available experimental data on locations and characteristics of nucleosome formation sites (NFSs), is the first curated NFS-oriented database. The object of the database is a single NFS described in an individual entry. When annotating results of NFS experimental mapping, we pay special attention to several important functional characteristics, such as the relationship between type of gene activity and nucleosome positioning, the influence of non-histone proteins on nucleosome formation, type of the variant of nucleosome positioning (translational or rotational), indication of tissue types and states of cell activity, description of experimental methods used and accuracy of nucleosome position determination, and the results of applying theoretical and computer methods to the analysis of contextual and conformational DNA properties. At present, the NPRD database contains 438 entries and integrates the data described in 124 original papers. The database URL: http://srs6.bionet.nsc.ru/srs6/. Then click the button ‘Databank’ and open the link NUCLEOSOME.
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作者：
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通讯作者：
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