The complete chloroplast genome sequence of Ehrharta erecta Lam. (Poaceae).
The complete chloroplast genome sequence of Ehrharta erecta Lam. (Poaceae).
复制标题
完整的叶绿体基因组序列。
DOI：
10.1080/23802359.2021.1931503
复制
发表时间：
2021-05-24
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Shi C
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Song WC;Feng Q;Zhang YJ;Shi C
首次对直立叶绿体完整的叶绿体（cp）基因组进行了测序和组装。在这项研究中，总基因组大小为134,511 bp，呈现出典型的四分结构，包含一个大的单拷贝（LSC，95,227 bp）和一个小的单拷贝（SSC，12,306 bp），由一对13,489 bp的反向重复序列（IRa，IRb）分隔。该叶绿体基因组的G+C含量为38.76%。基因注释分析鉴定出 130 个基因，包括 84 个蛋白质编码基因、38 个转移 RNA 和 8 个核糖体 RNA 基因。最大似然系统发育分析结果表明E．直立与O密切相关。 sativain 的系统发育关系。
The complete chloroplast (cp) genome ofEhrharta erectawas sequenced and assembled for the first time. In this study, The total genome size is 134,511 bp in length and demonstrates a typical quadripartite structure containing a large single copy (LSC, 95,227 bp) and a small single copy (SSC, 12,306 bp), separated by a pair of inverted repeats (IRa, IRb) of 13,489 bp. The G + C content of this chloroplast genome was 38.76%. Gene annotation analysis identified 130 genes including 84 protein-coding genes, 38 transfer RNA, and 8 ribosomal RNA genes. The maximum-likelihood phylogenetic analysis result showed thatE. erectawas closely related toO. sativain the phylogenetic relationship.
登录
查看更多内容
影响因子：
8.7
作者：
Wang X;Cheng F;Rohlsen D;Bi C;Wang C;Xu Y;Wei S;Ye Q;Yin T;Ye N
通讯作者：
Ye N
影响因子：
10.7
作者：
Kumar, Sudhir;Stecher, Glen;Tamura, Koichiro
通讯作者：
Tamura, Koichiro
影响因子：
1.7
作者：
Grove, Sara;Haubensak, Karen A.;Parker, Ingrid M.
通讯作者：
Parker, Ingrid M.
GESEQ-细胞器基因组的多功能和准确注释。
影响因子：
14.9
作者：
Tillich M;Lehwark P;Pellizzer T;Ulbricht-Jones ES;Fischer A;Bock R;Greiner S
通讯作者：
Greiner S
影响因子：
2.7
作者：
Manea, Anthony;Sloane, Daniel R.;Leishman, Michelle R.
通讯作者：
Leishman, Michelle R.