Improving cytidine and adenine base editors by expression optimization and ancestral reconstruction.

Improving cytidine and adenine base editors by expression optimization and ancestral reconstruction.
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通过表达优化和祖先重建改进胞苷和腺嘌呤碱基编辑器。

DOI:
10.1038/nbt.4172
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发表时间:
2018-10
影响因子:
46.9
通讯作者:
Liu DR
Liu DR
中科院分区:
工程技术1区
文献类型:
--
作者:
Koblan LW;Doman JL;Wilson C;Levy JM;Tay T;Newby GA;Maianti JP;Raguram A;Liu DR

文献摘要

参考文献

被引文献

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碱基编辑器能够在基因组DNA中实现靶向的单核苷酸转换。在这里,我们表明表达水平是碱基编辑效率的瓶颈。我们优化胞苷(BE 4)和腺嘌呤(ABE7.10)碱基编辑器的核定位信号和密码子使用的修改,和祖先的脱氨酶组分的重建。由此产生的BE4max、AncBE4max和ABEmax编辑器在各种哺乳动物细胞类型中以显著提高的效率校正致病性SNP。
Base editors enable targeted single-nucleotide conversion in genomic DNA. Here we show that expression levels are a bottleneck in base editing efficiency. We optimize cytidine (BE4) and adenine (ABE7.10) base editors by modification of nuclear localization signals and codon usage, and ancestral reconstruction of the deaminase component. The resulting BE4max, AncBE4max, and ABEmax editors correct pathogenic SNPs with substantially increased efficiency in a variety of mammalian cell types.
DOI: 10.1038/nbt.3803
发表时间: 2017-04
影响因子: 46.9
作者:
Kim YB;Komor AC;Levy JM;Packer MS;Zhao KT;Liu DR
通讯作者: Liu DR
DOI: 10.1371/journal.pone.0018556
发表时间: 2011
期刊: PloS one
影响因子: 3.7
作者:
Kim JH;Lee SR;Li LH;Park HJ;Park JH;Lee KY;Kim MK;Shin BA;Choi SY
通讯作者: Choi SY
DOI: 10.1038/nature17946
发表时间: 2016-05-19
期刊: Nature
影响因子: 64.8
作者:
Komor AC;Kim YB;Packer MS;Zuris JA;Liu DR
通讯作者: Liu DR
DOI: 10.1038/nmeth.1318
发表时间: 2009-05-01
期刊: NATURE METHODS
影响因子: 48
作者:
Gibson, Daniel G.;Young, Lei;Smith, Hamilton O.
通讯作者: Smith, Hamilton O.
DOI: 10.1093/molbev/msx281
发表时间: 2018-02-01
影响因子: 10.7
作者:
Hoang DT;Chernomor O;von Haeseler A;Minh BQ;Vinh LS
通讯作者: Vinh LS