Determinants of ELAV gene-specific regulation.
Determinants of ELAV gene-specific regulation.
复制标题
ELAV 基因特异性调控的决定因素。
DOI：
10.1042/bst0381122
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发表时间：
2010
影响因子：
3.9
通讯作者：
Soller M
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Soller M
rna结合蛋白如何在复杂的细胞环境中识别它们的靶标补体仍然知之甚少。序列退化和基因组尺度上短基序的冗余，在很大程度上避免了基因特异性ELAV（胚胎致死性异常视觉系统）/Hu蛋白结合普遍存在的富au基序的特异性靶基因的预测。利用果蝇的遗传工具，我们分析了体外elav的结合特性以及elav对其主要靶点（直立翼）在神经元中的依赖调节。这些研究表明，ELAV基因特异性调控的一个组成部分涉及在广泛的结合位点上与可变间距的短富u基序的组合结合。
How RNA-binding proteins recognize their complement of targets in a complex cellular environment remains poorly understood. Sequence degeneracy and redundancy of short motifs at genomic scales have mostly eluded predictions of specific target genes for gene-specific ELAV (embryonic lethal abnormal visual system)/Hu proteins that bind ubiquitous AU-rich motifs. Using the genetic tools ofDrosophila, we have analysed binding properties of ELAVin vitroand ELAV-dependent regulation of its major targetewg(erect wing) in neurons. These studies reveal that an integral part of ELAV gene-specific regulation involves combinatorial binding to variably spaced short U-rich motifs on an extensive binding site.
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