Ein homogener Assay der microRNA‐Reifung

Ein homogener Assay der microRNA‐Reifung
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microRNA-Reifung 均质化分析

DOI:
10.1002/ange.200601332
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发表时间:
2006
期刊:
影响因子:
--
通讯作者:
C. Arenz
C. Arenz
中科院分区:
--
文献类型:
--
作者:
Brian P. Davies;C. Arenz

文献摘要

参考文献

被引文献

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在手工业中进行了大量的放映工作,所有的试验都在进行中,这是一项新的试验。ALS nächstes wollten wir teir teen,ob statt des gereinigen rekombinanten Dice-Enzyms auch Zelllysate ALS Enzymquelle eingesetzt wollten wir teir teen,ob statt des rekombinanten Dice-Enzyms auch Zelllysate ALS Enzymquelle eingesetzt wollten wir teen teen,ob statt des gereinigen rekombinanten Dice-Enzyms auch Zelllysate ALS Enzymquelle eingesetzt Wollten Wir Testen,ob statt des rekombinanten Dice-Enzyms auch Zelllysate ALS EnzymDes hätte den Vorteil,den匀浆Assay in Realistischeren Bedingungen duchzuführen,da Dice in zellulärer Umgebung MIT Weiteren Proteinen Wie TRBP(反式激活反应结合蛋白)。[12][12][12]Um eine mögliche unSpezifische Durse dch eine and ere Rase zu verhindern,wurder Reaktionsansatz zusätzlich MIT RNase-Inhibitor versetzt.10%HEK-293-Zellsat zu-serer Sonde zu einem是一种新型的核糖核酸酶抑制剂。这些核糖核酸酶的抑制因子是一种新的核糖核酸酶抑制因子,它抑制了核糖核酸酶的水解酶活性和核糖核酸酶的活性。[14][14]这是一种新的技术和技术,其应用范围很广。[14]这是一种新的技术和技术,它的应用范围很广。[14]这是一种新的技术和技术。[15]在Einer Konzentation von 100μm Zeigte卡那霉素eine等40-ProZ中。这是一项非常重要的工作。除了十二肽外,还包括了十二肽、十二肽和十二肽
Um die Eignung der Reaktion für Screenings im Hochdurchsatzverfahren zu demonstrieren, wurden alle weiteren Experimente in handelsüblichen Mikrotiterplatten mit 96 Vertiefungen durchgeführt. Als nächstes wollten wir testen, ob statt des gereinigten rekombinanten Dicer-Enzyms auch Zelllysate als Enzymquelle eingesetzt werden können. Dies hätte den Vorteil, den homogenen Assay unter realistischeren Bedingungen durchzuführen, da Dicer in zellulärer Umgebung mit weiteren Proteinen wie TRBP (transactivating response binding protein) wechselwirkt. TRBP erhöht nicht nur die Geschwindigkeit der Dicer-vermittelten RNA-Hydrolyse in vitro, sondern es ist auch wesentlich für die korrekte zelluläre Funktion der miRNAs.[12] Um eine mögliche unspezifische Hydrolyse durch eine andere RNAse zu verhindern, wurde der Reaktionsansatz zusätzlich mit RNAse-Inhibitor versetzt. Wie erwartet führte die Zugabe von 10% HEK-293-Zelllysat zu unserer Sonde zu einem besonders schnellen Anstieg der Fluoreszenz, der durch unterschiedliche Konzentrationen an RNAse-Inhibitor nicht beeinflusst wurde. Der Zusatz von RNAse-Inhibitor führte auch beim Einsatz von gereinigtem rekombinantem Dicer zu keinerlei Inhibition der hydrolytischen Aktivität. Die Selektivität des RNAse-Inhibitors kann dadurch erklärt werden, dass Dicer als Ribonuclease der Klasse III nur geringe ¾hnlichkeit zu zB RNAse A hat, die zur Klasse I der RNAsen gezählt wird. Vorheriges Erhitzen des Zelllysats oder die Zugabe von Erbium (III)-chlorid, einem Inhibitor von Dicer,[13] hingegen führten dazu, dass die Fluoreszenz konstant auf dem Basiswert blieb.[14]Zur Beantwortung der Frage, ob die Sonde sich prinzipiell für die Identifizierung von Inhibitoren der miRNA-Reifung eignet, wurde der Reaktionsansatz jeweils mit unterschiedlichen potenziellen prä-miRNA-Liganden versetzt. Das Aminoglycosidantibiotikum Kanamycin bindet bevorzugt an bakterielle ribosomale 70S-RNA.[15] In einer Konzentration von 100 μm zeigte Kanamycin eine etwa 40-proz. Reduktion des Fluoreszenzanstiegs verglichen mit der Referenzreaktion. Da Dicer die inhärente Eigenschaft zur Bindung von miRNAs aufweist, haben wir drei von der Dicer-Aminosäuresequenz abgeleitete Dodecapeptide als potenzielle Binder
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