Family-wide characterization of the DENN domain Rab GDP-GTP exchange factors.
Family-wide characterization of the DENN domain Rab GDP-GTP exchange factors.
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DOI：
10.1083/jcb.201008051
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发表时间：
2010-10-18
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Barr FA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Yoshimura S;Gerondopoulos A;Linford A;Rigden DJ;Barr FA
17种具有Denn结构域的蛋白质的靶标或底物Rab GTP酶被鉴定。Rab在膜运输中发挥作用的一个关键要求是由GDP-GTP交换因子(GEF)特异性地激活，但63个人RAB中的大多数都没有已知的全环基金。我们已经对17个人类Denn结构域蛋白进行了系统的表征，并证明它们是10个RAB的特异性GEF。DENND1A/1B定位于质膜上的网状蛋白斑块，并在内吞途径中激活Rab35，将志贺毒素输送到跨高尔基网络。DENND2 GEF以肌动蛋白细丝为靶标，控制Rab9依赖的甘露糖-6-磷酸受体向溶酶体的转运。DENND4 GEF靶向高尔基体附近的管状膜隔室，在那里它们激活Rab10，这表明在上皮细胞的基侧极化分类中，与作用于Rab8的非Denn环境基金Sec2在根尖分类中的作用互补。DENND1C、DENND3、DENND5A/5B、MTMR5/13和MADD分别激活Rab13、Rab12、Rab39、Rab28和Rab27A/27B。综上所述，这些发现为未来研究RAB的调控和功能提供了基础。
Target or substrate Rab GTPases are identified for 17 proteins with DENN domains. A key requirement for Rab function in membrane trafficking is site-specific activation by GDP-GTP exchange factors (GEFs), but the majority of the 63 human Rabs have no known GEF. We have performed a systematic characterization of the 17 human DENN domain proteins and demonstrated that they are specific GEFs for 10 Rabs. DENND1A/1B localize to clathrin patches at the plasma membrane and activate Rab35 in an endocytic pathway trafficking Shiga toxin to the trans-Golgi network. DENND2 GEFs target to actin filaments and control Rab9-dependent trafficking of mannose-6-phosphate receptor to lysosomes. DENND4 GEFs target to a tubular membrane compartment adjacent to the Golgi, where they activate Rab10, which suggests a function in basolateral polarized sorting in epithelial cells that compliments the non-DENN GEF Sec2 acting on Rab8 in apical sorting. DENND1C, DENND3, DENND5A/5B, MTMR5/13, and MADD activate Rab13, Rab12, Rab39, Rab28, and Rab27A/27B, respectively. Together, these findings provide a basis for future studies on Rab regulation and function.
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DOI：
10.1074/jbc.m804134200
发表时间：
2008-08-22
期刊：
The Journal of biological chemistry
影响因子：
--
作者：
Figueiredo AC;Wasmeier C;Tarafder AK;Ramalho JS;Baron RA;Seabra MC
通讯作者：
Seabra MC
影响因子：
11.8
作者：
Denef, Natalie;Chen, Yu;Schupbach, Trudi
通讯作者：
Schupbach, Trudi
影响因子：
21.3
作者：
Haas, AK;Fuchs, E;Barr, FA
通讯作者：
Barr, FA
DOI：
10.1083/jcb.200612068
发表时间：
2007-06-18
期刊：
The Journal of cell biology
影响因子：
--
作者：
Fuchs E;Haas AK;Spooner RA;Yoshimura S;Lord JM;Barr FA
通讯作者：
Barr FA
DOI：
10.1083/jcb.138.2.283
发表时间：
1997-07-28
期刊：
The Journal of cell biology
影响因子：
--
作者：
Díaz E;Schimmöller F;Pfeffer SR
通讯作者：
Pfeffer SR