Mapping the molecular interface between the sigma(70) subunit of E. coli RNA polymerase and T4 AsiA.
Mapping the molecular interface between the sigma(70) subunit of E. coli RNA polymerase and T4 AsiA.
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绘制大肠杆菌 RNA 聚合酶 sigma(70) 亚基和 T4 AsiA 之间的分子界面。
DOI：
10.1006/jmbi.2001.4445
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发表时间：
2001
影响因子：
5.6
通讯作者：
K. Severinov
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
L. Minakhin;Julio A. Camarero;M. Holford;Christian N. Parker;Tom W. Muir;K. Severinov
噬菌体 T4 抗 sigma 蛋白 AsiA (10 kDa) 通过与大肠杆菌 RNA 聚合酶的 sigma(70) 亚基结合，协调从宿主和早期病毒转录到中期病毒转录的转变。 sigma(70)-AsiA 复合物形成的分子决定因素尚不清楚。在这里，我们使用组合肽化学、蛋白质-蛋白质交联和突变分析来研究 AsiA 与其靶标（包含保守区 4.2 的 33 个氨基酸残基长 sigma(70) 肽）之间的相互作用。许多区域 4.2 氨基酸残基接触 AsiA，这可能完全封闭区域 4.2 的 DNA 结合表面。虽然区域 4.2 中没有一个氨基酸残基单独负责与 AsiA 的非常紧密的相互作用，但位于区域 4.2 推定 DNA 识别元件之外的 sigma(70) Lys593 和 Arg596 贡献最大。在 AsiA 中，前 20 个氨基酸残基对于与 sigma(70) 相互作用是必要且充分的。我们的结果阐明了 sigma(70)-AsiA 相互作用的细节，并为设计具有改变的特异性的 AsiA 衍生物开辟了道路。
Bacteriophage T4 antisigma protein AsiA (10 kDa) orchestrates a switch from the host and early viral transcription to middle viral transcription by binding to the sigma(70) subunit of E. coli RNA polymerase. The molecular determinants of sigma(70)-AsiA complex formation are not known. Here, we used combinatorial peptide chemistry, protein-protein crosslinking, and mutational analysis to study the interaction between AsiA and its target, the 33 amino acid residues-long sigma(70) peptide containing conserved region 4.2. Many region 4.2 amino acid residues contact AsiA, which likely completely occludes the DNA-binding surface of region 4.2. Though none of region 4.2 amino acid residues is singularly responsible for the very tight interaction with AsiA, sigma(70) Lys593 and Arg596 which lie outside the putative DNA recognition element of region 4.2, contribute the most. In AsiA, the first 20 amino acid residues are both necessary and sufficient for interactions with sigma(70). Our results clarify details of sigma(70)-AsiA interaction and open the way for engineering AsiA derivatives with altered specificities.
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噬菌体 T4 AsiA 对大肠杆菌 RNA 聚合酶的抑制。
DOI：
10.1006/jmbi.1998.1742
发表时间：
1998
期刊：
Journal of molecular biology.
影响因子：
--
作者：
Severinova,E;Severinov,K;Darst,SA
通讯作者：
Darst,SA
通过光亲和交联直接绘制甲状旁腺激素/甲状旁腺激素相关蛋白受体内的激动剂结合域。
DOI：
10.1073/pnas.94.8.3644
发表时间：
1997
影响因子：
11.1
作者：
Zhou,AT;Bessalle,R;Bisello,A;Nakamoto,C;Rosenblatt,M;Suva,LJ;Chorev,M
通讯作者：
Chorev,M
DOI：
10.1073/pnas.93.3.1119
发表时间：
1996-02-06
影响因子：
11.1
作者：
Tang, H;Sun, XQ;Ebright, RH
通讯作者：
Ebright, RH
影响因子：
5.6
作者：
SIEGELE, DA;HU, JC;GROSS, CA
通讯作者：
GROSS, CA
兔骨骼肌肌钙蛋白-C N 末端疏水口袋的残基 48 和 82 与肌钙蛋白-I 的 Met121 光交联。
DOI：
10.1021/bi9824341
发表时间：
1999
期刊：
Biochemistry.
影响因子：
--
作者：
Luo,Y;Leszyk,J;Qian,Y;Gergely,J;Tao,T
通讯作者：
Tao,T