Database Resources of the BIG Data Center in 2018.
Database Resources of the BIG Data Center in 2018.
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2018年大数据中心数据库资源
DOI：
10.1093/nar/gkx897
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发表时间：
2018-01-04
影响因子：
14.9
通讯作者：
BIG Data Center Members
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
BIG Data Center Members
中国科学院北京基因组研究所（BIG）的BIG数据中心提供免费开放的数据库资源，以支持学术界和工业界的全球研究活动。随着大量组学数据以更大的规模和速度生成，BIG数据中心正在通过大数据集成和增值策展（包括BioCode）不断扩展，更新和丰富其核心数据库资源（生物信息学工具代码的储存库），BioProject（一个生物项目库），BioSample（生物样品库），基因组序列档案（GSA，用于存档原始序列读数的数据存储库），基因组仓库（GWH，一个集中的资源住房基因组规模的数据），基因组变异图（GVM，基因组变异的公共知识库），基因表达星云（GEN，基于RNA-Seq数据的基因表达谱数据库），甲基化银行（MethBank，DNA甲基化组的综合数据库）和科学维基（一系列用于社区注释的生物知识维基）。此外，还提供三项特色网络服务，即：BIG Search（搜索即服务;可扩展的域间文本搜索引擎），BIG SSO（单点登录即服务;用户访问控制系统，可以使用单个ID和密码访问多个独立系统）和Gsub（提交即服务;所有相关资源的统一提交服务）。所有这些资源都可以通过BIG数据中心的主页http://bigd.big.ac.cn公开访问。
The BIG Data Center at Beijing Institute of Genomics (BIG) of the Chinese Academy of Sciences provides freely open access to a suite of database resources in support of worldwide research activities in both academia and industry. With the vast amounts of omics data generated at ever-greater scales and rates, the BIG Data Center is continually expanding, updating and enriching its core database resources through big-data integration and value-added curation, including BioCode (a repository archiving bioinformatics tool codes), BioProject (a biological project library), BioSample (a biological sample library), Genome Sequence Archive (GSA, a data repository for archiving raw sequence reads), Genome Warehouse (GWH, a centralized resource housing genome-scale data), Genome Variation Map (GVM, a public repository of genome variations), Gene Expression Nebulas (GEN, a database of gene expression profiles based on RNA-Seq data), Methylation Bank (MethBank, an integrated databank of DNA methylomes), and Science Wikis (a series of biological knowledge wikis for community annotations). In addition, three featured web services are provided, viz., BIG Search (search as a service; a scalable inter-domain text search engine), BIG SSO (single sign-on as a service; a user access control system to gain access to multiple independent systems with a single ID and password) and Gsub (submission as a service; a unified submission service for all relevant resources). All of these resources are publicly accessible through the home page of the BIG Data Center at http://bigd.big.ac.cn.
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