Introduction to the BioChemical Library (BCL): An Application-Based Open-Source Toolkit for Integrated Cheminformatics and Machine Learning in Computer-Aided Drug Discovery.
Introduction to the BioChemical Library (BCL): An Application-Based Open-Source Toolkit for Integrated Cheminformatics and Machine Learning in Computer-Aided Drug Discovery.
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DOI：
10.3389/fphar.2022.833099
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发表时间：
2022
影响因子：
5.6
通讯作者：
Meiler J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Brown BP;Vu O;Geanes AR;Kothiwale S;Butkiewicz M;Lowe EW Jr;Mueller R;Pape R;Mendenhall J;Meiler J
生物化学库（BCL）化学信息学工具包是一个基于应用的学术开源软件包，旨在将传统的小分子化学信息学工具与基于机器学习的定量结构-活性/性质关系（QSAR/QSPR）建模相结合。在这篇教学文章中，我们详细介绍了核心BCL化学信息学功能，展示了传统任务（例如，计算化学性质、估计药物相似性）可以容易地与机器学习相结合。此外，我们还包括了多个涉及高级使用领域的示例，例如基于反应的库设计。我们预计，这份手稿将成为计算机辅助药物发现研究人员的宝贵资源，他们希望将模块化化学信息学和机器学习工具整合到他们的管道中。
The BioChemical Library (BCL) cheminformatics toolkit is an application-based academic open-source software package designed to integrate traditional small molecule cheminformatics tools with machine learning-based quantitative structure-activity/property relationship (QSAR/QSPR) modeling. In this pedagogical article we provide a detailed introduction to core BCL cheminformatics functionality, showing how traditional tasks (e.g., computing chemical properties, estimating druglikeness) can be readily combined with machine learning. In addition, we have included multiple examples covering areas of advanced use, such as reaction-based library design. We anticipate that this manuscript will be a valuable resource for researchers in computer-aided drug discovery looking to integrate modular cheminformatics and machine learning tools into their pipelines.
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影响因子：
5.6
作者：
Friedrich, Nils-Ole;Meyder, Agnes;Kirchmair, Johannes
通讯作者：
Kirchmair, Johannes
影响因子：
3.7
作者：
DeLuca S;Khar K;Meiler J
通讯作者：
Meiler J
影响因子：
21.8
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
50.3
作者：
Hanker AB;Brown BP;Meiler J;Marín A;Jayanthan HS;Ye D;Lin CC;Akamatsu H;Lee KM;Chatterjee S;Sudhan DR;Servetto A;Brewer MR;Koch JP;Sheehan JH;He J;Lalani AS;Arteaga CL
通讯作者：
Arteaga CL
影响因子：
5.6
作者：
Friedrich, Nils-Ole, V;Flachsenberg, Florian;Rarey, Matthias
通讯作者：
Rarey, Matthias