metabolomicsR: a streamlined workflow to analyze metabolomic data in R.
metabolomicsR: a streamlined workflow to analyze metabolomic data in R.
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DOI：
10.1093/bioadv/vbac067
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发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
metabolomicsR是一个精简、灵活和用户友好的R软件包，用于预处理、分析和可视化代谢组学数据。metabolomicsR包括样品和代谢物质量控制、异常值检测、缺失值输入、降维、批效应归一化、数据集成、回归、代谢物注释以及数据和结果可视化的综合功能。在本应用程序笔记中，我们将逐步演示如何使用这个包中的主要函数。metabolomicsR包可通过CRAN和GitHub （https://github.com/XikunHan/metabolomicsR/）获得。一个循序渐进的在线教程可以在https://xikunhan.github.io/metabolomicsR/docs/articles/Introduction.html上找到。补充数据可在生物信息学进展在线获取。
metabolomicsR is a streamlined, flexible and user-friendly R package to preprocess, analyze and visualize metabolomic data. metabolomicsR includes comprehensive functionalities for sample and metabolite quality control, outlier detection, missing value imputation, dimensional reduction, batch effect normalization, data integration, regression, metabolite annotation and visualization of data and results. In this application note, we demonstrate the step-by-step use of the main functions from this package. The metabolomicsR package is available via CRAN and GitHub (https://github.com/XikunHan/metabolomicsR/). A step-by-step online tutorial is available at https://xikunhan.github.io/metabolomicsR/docs/articles/Introduction.html. Supplementary data are available at Bioinformatics Advances online.
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影响因子：
3.3
作者：
Ejigu, Bedilu Alamirie;Valkenborg, Dirk;Berg, Maya
通讯作者：
Berg, Maya
影响因子：
4.1
作者：
Pinu, Farhana R.;Beale, David J.;Wishart, David
通讯作者：
Wishart, David
影响因子：
14.9
作者：
Pang Z;Chong J;Zhou G;de Lima Morais DA;Chang L;Barrette M;Gauthier C;Jacques PÉ;Li S;Xia J
通讯作者：
Xia J
DOI：
10.1038/nrm.2016.25
发表时间：
2016-07
期刊：
Nature reviews. Molecular cell biology
影响因子：
--
作者：
Johnson CH;Ivanisevic J;Siuzdak G
通讯作者：
Siuzdak G
DOI：
10.1093/bioinformatics/btab741
发表时间：
2022-01-27
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Chetnik K;Benedetti E;Gomari DP;Schweickart A;Batra R;Buyukozkan M;Wang Z;Arnold M;Zierer J;Suhre K;Krumsiek J
通讯作者：
Krumsiek J