The University of Minnesota Biocatalysis/Biodegradation Database: improving public access.
The University of Minnesota Biocatalysis/Biodegradation Database: improving public access.
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DOI：
10.1093/nar/gkp771
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发表时间：
2010-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Wackett LP
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Gao J;Ellis LB;Wackett LP
明尼苏达大学生物催化/生物降解数据库(UM-BBD，http://umbbd.msi.umn.edu/))成立于1995年，目前包含近1200种化合物、800多种酶、近1300种反应和近500种微生物条目的信息。除了这些数据，它还包括生物化学周期表(UM-BPT)和基于规则的路径预测系统(UM-PPS)(http://umbbd.msi.umn.edu/predict/))，该系统预测有机化合物微生物降解的合理路径。目前，UM-PPS包含260条生物转化规则，这些规则源自UM-BBD和科学文献中发现的反应。公众对UM-BBD数据的访问正在增加。UM-BBD化合物数据现在被贡献给公共化学数据库PubChem和ChemSpider。苏黎世理工学院正在开发UM-BBD、UM-BPT和UM-PPS的新镜像网站，以提高从世界任何地方在线访问的速度和可靠性。
The University of Minnesota Biocatalysis/Biodegradation Database (UM-BBD, http://umbbd.msi.umn.edu/) began in 1995 and now contains information on almost 1200 compounds, over 800 enzymes, almost 1300 reactions and almost 500 microorganism entries. Besides these data, it includes a Biochemical Periodic Table (UM-BPT) and a rule-based Pathway Prediction System (UM-PPS) (http://umbbd.msi.umn.edu/predict/) that predicts plausible pathways for microbial degradation of organic compounds. Currently, the UM-PPS contains 260 biotransformation rules derived from reactions found in the UM-BBD and scientific literature. Public access to UM-BBD data is increasing. UM-BBD compound data are now contributed to PubChem and ChemSpider, the public chemical databases. A new mirror website of the UM-BBD, UM-BPT and UM-PPS is being developed at ETH Zürich to improve speed and reliability of online access from anywhere in the world.
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影响因子：
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作者：
Ellis LB;Roe D;Wackett LP
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Wackett LP
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通讯作者：
Ye J