Recovering genotypes and phenotypes using allele-specific genes.
Recovering genotypes and phenotypes using allele-specific genes.
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DOI：
10.1186/s13059-021-02477-x
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发表时间：
2021-09-07
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
Gerstein M
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Gürsoy G;Lu N;Wagner S;Gerstein M
随着最近使用大量个体的RNA测序工作的增加，测量等位基因特异性基因表达变得越来越频繁。在这里，我们报道，尽管不包含明确的变异信息，一个已知的等位基因特异性基因列表足以恢复关键变异，并将个体与他们的基因型和表型联系起来。这就产生了一个隐私难题。在线版本包含补充材料，可在10.1186/s13059-021-02477-x上获得。
With the recent increase in RNA sequencing efforts using large cohorts of individuals, surveying allele-specific gene expression is becoming increasingly frequent. Here, we report that, despite not containing explicit variant information, a list of genes known to be allele-specific in an individual is enough to recover key variants and link the individuals back to their genotypes and phenotypes. This creates a privacy conundrum. The online version contains supplementary material available at 10.1186/s13059-021-02477-x.
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