Extending foldamer design beyond α-helix mimicry: α/β-peptide inhibitors of vascular endothelial growth factor signaling.
Extending foldamer design beyond α-helix mimicry: α/β-peptide inhibitors of vascular endothelial growth factor signaling.
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DOI：
10.1021/ja302469a
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发表时间：
2012-05-09
影响因子：
15
通讯作者：
Gellman, Samuel H.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Haase, Holly S.;Peterson-Kaufman, Kimberly J.;Levengood, Sheeny K. Lan;Checco, James W.;Murphy, William L.;Gellman, Samuel H.
已经探索了多种策略来模拟蛋白质的α-螺旋片段所展示的表面，目的是产生螺旋介导的蛋白质-蛋白质相互作用的抑制剂。然而，蛋白质上的许多识别表面在拓扑学上比单个α-螺旋更复杂，更不规则。我们描述了努力开发肽折叠体，结合到血管内皮生长因子（VEGF）的不规则受体识别表面。我们的方法开始于Fairbrother等人（Biochemistry 1998，37，17754）先前报道的19个残基的α-肽，以结合VEGF上的该表面。系统评价整个19-mer序列中的α → β置换使我们能够鉴定含有高达约30% β残基的同源物，保留对VEGF的显著亲和力，并显示出对蛋白水解的实质性抗性。这些α/β-肽可以阻断VEGF刺激的人脐静脉内皮细胞增殖。
Diverse strategies have been explored to mimic the surface displayed by an α-helical segment of a protein, with the goal of creating inhibitors of helix-mediated protein-protein interactions. Many recognition surfaces on proteins, however, are topologically more complex and less regular than a single α-helix. We describe efforts to develop peptidic foldamers that bind to the irregular receptor-recognition surface of vascular endothelial growth factor (VEGF). Our approach begins with a 19-residue α-peptide previously reported by Fairbrother et al. (Biochemistry 1998, 37, 17754) to bind to this surface on VEGF. Systematic evaluation of α → β replacements throughout this 19-mer sequence enabled us to identify homologues that contain up to ~30% β residues, retain significant affinity for VEGF, and display substantial resistance to proteolysis. These α/β-peptides can block VEGF-stimulated proliferation of human umbilical vein endothelial cells.
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影响因子：
4
作者：
Buhrlage, Sara J.;Bates, Caleb A.;Rowe, Steven P.;Minter, Aaron R.;Brennan, Brian B.;Majmudar, Chinmay Y.;Wemmer, David E.;Al-Hashimi, Hashim;Mapp, Anna K.
通讯作者：
Mapp, Anna K.
影响因子：
15
作者：
Hara, T;Durell, SR;Appella, DH
通讯作者：
Appella, DH
影响因子：
2.9
作者：
Fry, David C.
通讯作者：
Fry, David C.
DOI：
10.1073/pnas.0801135105
发表时间：
2008-07-08
影响因子：
11.1
作者：
Horne, W. Seth;Price, Joshua L.;Gellman, Samuel H.
通讯作者：
Gellman, Samuel H.
DOI：
10.1073/pnas.0902663106
发表时间：
2009-09-01
影响因子：
11.1
作者：
Horne, W. Seth;Johnson, Lisa M.;Gellman, Samuel H.
通讯作者：
Gellman, Samuel H.