A chemical labeling of N6-formyl adenosine (f6A) RNA
A chemical labeling of N6-formyl adenosine (f6A) RNA
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N6-甲酰腺苷 (f6A) RNA 的化学标记
DOI：
10.1016/j.cclet.2021.09.028
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发表时间：
2021-09
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Liang Cheng
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Li-Jun Xie;Cui-Lian Lin;Li Liu;Liang Cheng
n6 -甲基腺苷（m6A）是mrna中一个重要的表观遗传标记，影响多种物种的广泛生物学功能。然而，化学惰性甲基阻止了这种修饰的直接标记，以进行后续的检测和测序。因此，目前大多数m6A的标记方法仍然存在依赖于利用相应的甲基转移酶的局限性，导致效率不足。在这里，我们提出了一种选择性烷基化then6 -甲酰基腺苷（f6A）的方法，f6A是m6A化学氧化过程中的关键中间体，具有烷基化功能，可以通过点击反应进一步标记。这种共价标记方法将有助于亲和纯化、检测和全基因组分析研究。
N6-methyl adenosine (m6A) is an eminent epigenetic mark in mRNAs that affects a broad range of biological functions in diverse species. However, the chemically inert methyl group prevents a direct labeling of this modification for subsequent detection and sequencing. Therefore, most current approaches for the labeling of m6A still have limitations of relying on the utilization of corresponding methyltransferases, which resulted in the lacking of efficiency. Here we present an approach which selectively alkylated theN6-formyl adenosine (f6A), the key intermediate during chemical oxidation of m6A, with an alkyne functionality that can be further labeled with click reactions. This covalent labeling approach will be able to facilitate in the affinity purification, detection and genome-wide profiling studies.
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DOI：
10.6084/m9.figshare.1004808.v1
发表时间：
2014-10
期刊：
--
影响因子：
--
作者：
S. Endre
通讯作者：
S. Endre
DNA中5-甲酰胞嘧啶和5-甲酰尿嘧啶的检测及应用
影响因子：
18.3
作者：
Wang Yafen;Zhang Xiong;Zou Guangrong;Peng Shuang;Liu Chaoxing;Zhou Xiang
通讯作者：
Zhou Xiang
影响因子：
48
作者：
Meyer, Kate D.
通讯作者：
Meyer, Kate D.
影响因子：
64.5
作者：
Meyer KD;Saletore Y;Zumbo P;Elemento O;Mason CE;Jaffrey SR
通讯作者：
Jaffrey SR
通过揭示包含 YTH 结构域的蛋白质的多样性作用来了解 m6A 功能
影响因子：
2.6
作者：
Yuanling Zhao;Youhua Liu;Ruifan Wu;Zhen Bi;Yongxi Yao;Qing Liu;Yizhen Wang;Xinxia Wang
通讯作者：
Xinxia Wang