Identification of a Nonsense-Mediated Decay pathway at the Endoplasmic Reticulum
Identification of a Nonsense-Mediated Decay pathway at the Endoplasmic Reticulum
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内质网无义介导的衰变途径的鉴定
DOI：
10.1101/2020.02.24.954453
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发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Longman D
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Longman D
无义介导的衰变（NMD）是发生在细胞质中的一种依赖翻译的RNA质量控制机制。然而，目前尚不清楚NMD如何调节内质网（ER）翻译的rna的稳定性。在这里，我们确定了一个专门用于er翻译mrna的局部NMD途径。我们之前发现NBAS是一种新的NMD因子，它是Syntaxin 18复合体的一个组成部分，参与高尔基到内质网的运输。在这里，我们证明了NBAS在NMD中具有独立的功能。这种ER-NMD通路需要NBAS与核心NMD因子UPF1的相互作用，UPF1部分位于转座子附近的ER。NBAS和UPF1共同调节er相关转录本的稳定性，特别是那些与细胞应激反应相关的转录本。我们提出了一个模型，其中NBAS将UPF1招募到内质网膜并激活内质网专用的NMD通路，从而通过确保内质网翻译mrna的质量控制来提供内质网保护功能。图形摘要：thighlightsnbas是一种定位于内质网（ER）膜上的NMD因子。NBAS在高尔基向内质网逆行运输和ER- nmdnbas将核心NMD因子UPF1招募到ER-NMD膜上，ER-NMD通路以内质网翻译的降解mrna为靶标
Nonsense-mediated decay (NMD) is a translation-dependent RNA quality control mechanism that occurs in the cytoplasm. However, it is unknown how NMD regulates the stability of RNAs translated at the Endoplasmic Reticulum (ER). Here, we identify a localized NMD pathway dedicated to ER-translated mRNAs. We previously identified NBAS, a component of the Syntaxin 18 complex involved in Golgi-to-ER trafficking, as a novel NMD factor. Here, we show that NBAS fulfils an independent function in NMD. This ER-NMD pathway requires the interaction of NBAS with the core NMD factor UPF1, which is partially localized at the ER in the proximity of the translocon. NBAS and UPF1 co-regulate the stability of ER-associated transcripts, in particular those associated with the cellular stress response. We propose a model where NBAS recruits UPF1 to the membrane of the ER and activates an ER-dedicated NMD pathway, thus providing an ER protective function by ensuring quality control of ER-translated mRNAs.Graphical AbstractHIGHLIGHTSNBAS is an NMD factor that localizes to the membrane of the endoplasmic reticulum (ER)NBAS has dual, independent, roles in Golgi-to-ER retrograde transport and in ER-NMDNBAS recruits the core NMD factor UPF1 to the membrane of the ERThe ER-NMD pathway targets for degradation mRNAs that are translated at the ER
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btu638
发表时间：
2015-01-15
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Anders S;Pyl PT;Huber W
通讯作者：
Huber W
DOI：
10.1007/978-1-61779-005-8_19
发表时间：
2011
期刊：
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
影响因子：
--
作者：
Jagannathan, Sujatha;Nwosu, Christine;Nicchitta, Christopher V
通讯作者：
Nicchitta, Christopher V
DOI：
10.1073/pnas.1000993107
发表时间：
2010-06-01
影响因子：
11.1
作者：
Buchwald, Gretel;Ebert, Judith;Conti, Elena
通讯作者：
Conti, Elena
影响因子：
14.9
作者：
Applequist, SE;Selg, M;Jack, HM
通讯作者：
Jack, HM
影响因子：
14.9
作者：
Anastasaki C;Longman D;Capper A;Patton EE;Cáceres JF
通讯作者：
Cáceres JF