ShiBASE: an integrated database for comparative genomics of Shigella.
ShiBASE: an integrated database for comparative genomics of Shigella.
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DOI：
10.1093/nar/gkj033
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发表时间：
2006-01-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Jin, Qi
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Yang, Jian;Chen, Lihong;Yu, Jun;Sun, Lilian;Jin, Qi
在主要的肠道细菌病原体中，志贺氏菌被发现表现出极端的基因组多样性和动态性，这对比较基因组研究提出了挑战。为了促进这一领域的进一步研究，我们构建了一个综合在线数据库ShiBASE（），其中包含四个物种的志贺氏菌基因组序列和43个血清型的比较基因组杂交（CGH）数据。 ShiBASE 提供 DNA 序列、基因顺序、代谢途径和毒力因子的在线比较分析。此外，ShiBASE还有新开发的在线比较可视化服务Shi-align，可以将任何查询序列与参考基因组序列进行比对。
Among the major enteric bacterial pathogens, Shigella is found to display extreme genome diversity and dynamics, which imposes a challenge in comparative genomic studies. To facilitate further studies in this area, we have constructed an integrated online database, ShiBASE (),which contains Shigella genomic sequences of four species and additional comparative genomic hybridization (CGH) data of 43 serotypes. ShiBASE offers online comparative analysis on DNA sequences, gene orders, metabolic pathways and virulence factors. In addition, ShiBASE has a newly developed online comparative visualization service, Shi-align, which enables the alignment of any query sequence with the reference genome sequences.
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志贺氏菌种类的基因组动力学和多样性，杆菌痢疾的病因学剂。
影响因子：
14.9
作者：
Yang, F;Yang, J;Zhang, XB;Chen, LH;Jiang, Y;Yan, YL;Tang, XD;Wang, J;Xiong, ZH;Dong, J;Xue, Y;Zhu, YF;Xu, XY;Sun, LL;Chen, SX;Nie, H;Peng, JP;Xu, JG;Wang, Y;Yuan, ZH;Wen, YM;Yao, ZJ;Shen, Y;Qiang, BQ;Hou, YD;Yu, J;Jin, Q
通讯作者：
Jin, Q
DOI：
10.1083/jcb.146.6.1319
发表时间：
1999-09-20
期刊：
The Journal of cell biology
影响因子：
--
作者：
Egile C;Loisel TP;Laurent V;Li R;Pantaloni D;Sansonetti PJ;Carlier MF
通讯作者：
Carlier MF
影响因子：
14.9
作者：
Barré, A;de Daruvar, A;Blanchard, A
通讯作者：
Blanchard, A
DOI：
10.1073/pnas.95.7.3943
发表时间：
1998-03-31
影响因子：
11.1
作者：
Maurelli, AT;Fernández, RE;Fasano, A
通讯作者：
Fasano, A
影响因子：
14.9
作者：
THOMPSON, JD;HIGGINS, DG;GIBSON, TJ
通讯作者：
GIBSON, TJ