The N-terminus of GalE induces tmRNA activity in Escherichia coli.
The N-terminus of GalE induces tmRNA activity in Escherichia coli.
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DOI：
10.1371/journal.pone.0015207
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发表时间：
2010-12-07
期刊：
影响因子：
3.7
通讯作者：
Hayes CS
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Ruhe ZC;Hayes CS
tmRNA质量控制系统识别停滞的翻译复合物，并在称为“核糖体拯救”的过程中促进核糖体再循环。在核糖体拯救过程中，新生链被tmRNA编码的SsrA肽标记，其靶向标记的蛋白质进行降解。在大肠杆菌中，tmRNA拯救被截短的信息捕获的核糖体，以及在延伸和终止过程中暂停的核糖体。在这里，我们描述了一个新的翻译暂停决定簇，导致SsrA肽标签的E。coli GalE蛋白（UDP-半乳糖4-差向异构酶）。GalE链在超过150个位点处被标记，主要在整个C-末端结构域的不同簇内。这些标记位点不对应于罕见的密码子簇和同义重编码的galE基因标记的影响不大。此外，标记在很大程度上不受稳定或不稳定galE转录的扰动的影响。GalE-硫氧还蛋白（TrxA）融合蛋白的检查表明，GalE C-末端结构域融合到N-末端TrxA结构域时不再标记。相反，N-末端的GalE诱导标签内的融合的C-末端TrxA结构域。这些发现表明GalE N-末端的翻译诱导C-末端结构域的后续标记。我们建议，共翻译成熟的GalE N-末端结构域的影响核糖体暂停和随后的tmRNA活性。
The tmRNA quality control system recognizes stalled translation complexes and facilitates ribosome recycling in a process termed ‘ribosome rescue’. During ribosome rescue, nascent chains are tagged with the tmRNA-encoded SsrA peptide, which targets tagged proteins for degradation. In Escherichia coli, tmRNA rescues ribosomes arrested on truncated messages, as well as ribosomes that are paused during elongation and termination. Here, we describe a new translational pausing determinant that leads to SsrA peptide tagging of the E. coli GalE protein (UDP-galactose 4-epimerase). GalE chains are tagged at more than 150 sites, primarily within distinct clusters throughout the C-terminal domain. These tagging sites do not correspond to rare codon clusters and synonymous recoding of the galE gene had little effect on tagging. Moreover, tagging was largely unaffected by perturbations that either stabilize or destabilize the galE transcript. Examination of GalE-thioredoxin (TrxA) fusion proteins showed that the GalE C-terminal domain is no longer tagged when fused to an N-terminal TrxA domain. Conversely, the N-terminus of GalE induced tagging within the fused C-terminal TrxA domain. These findings suggest that translation of the GalE N-terminus induces subsequent tagging of the C-terminal domain. We propose that co-translational maturation of the GalE N-terminal domain influences ribosome pausing and subsequent tmRNA activity.
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DOI：
10.1073/pnas.90.20.9725
发表时间：
1993-10-15
影响因子：
11.1
作者：
ALIX, JH;GUERIN, MF
通讯作者：
GUERIN, MF
影响因子：
10.5
作者：
Gottesman, S;Roche, E;Sauer, RT
通讯作者：
Sauer, RT
影响因子：
3.6
作者：
Christensen-Dalsgaard M;Jørgensen MG;Gerdes K
通讯作者：
Gerdes K
大肠杆菌K-12的构造框架，单基因敲除突变体：Keio Collection。
影响因子：
9.9
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
16
作者：
Cruz-Vera, LR;Rajagopal, S;Yanofsky, C
通讯作者：
Yanofsky, C