Evolution in protein interaction networks: co-evolution, rewiring and the role of duplication.
Evolution in protein interaction networks: co-evolution, rewiring and the role of duplication.
复制标题
蛋白质相互作用网络的进化：共同进化、重新布线和复制的作用。
DOI：
10.1042/bst0370768
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发表时间：
2009
影响因子：
3.9
通讯作者：
Robertson DL
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Robertson DL
分子功能是蛋白质协同工作的结果，由高度特异性的相互作用介导。因此，蛋白质相互作用的维持和改变可以被认为是分子功能和突变之间的主要联系之一。因此，蛋白质相互作用数据集可以直接用于研究功能进化。就约束变化而言，相互作用的分子的共同进化是一个非常微妙的过程。这对用于预测蛋白质-蛋白质相互作用的信号具有影响。就功能变化而言，相互作用网络的“重新布线”，基因复制至关重要。有趣的是，一旦发生复制，所涉及的基因被保留的概率与它们是如何产生的有关。在本文中，我们讨论了我们最近在这方面的一些工作。
Molecular function is the result of proteins working together, mediated by highly specific interactions. Maintenance and change of protein interactions can thus be considered one of the main links between molecular function and mutation. As a consequence, protein interaction datasets can be used to study functional evolution directly. In terms of constraining change, the co-evolution of interacting molecules is a very subtle process. This has implications for the signal being used to predict protein–protein interactions. In terms of functional change, the ‘rewiring’ of interaction networks, gene duplication is critically important. Interestingly, once duplication has occurred, the genes involved have different probabilities of being retained related to how they were generated. In the present paper, we discuss some of our recent work in this area.
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