Elucidating the biology of transcription factor-DNA interaction for accurate identification of cis-regulatory elements.
Elucidating the biology of transcription factor-DNA interaction for accurate identification of cis-regulatory elements.
复制标题
阐明转录因子-DNA相互作用的生物学，以准确鉴定顺式调节元件。
DOI：
10.1016/j.pbi.2022.102232
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发表时间：
2022-08
影响因子：
9.5
通讯作者：
Huang, Shao-shan Carol
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Hajheidari, Mohsen;Huang, Shao-shan Carol
关键词：
转录因子（Transcription Factor，TF）通过与特定的顺式调控模块结合，整合发育和环境信号，调控基因表达模式的时空特异性，在决定细胞命运方面发挥着重要作用。在时间和空间上精确识别功能性TF结合位点不仅将彻底改变我们对控制细胞命运决定的调控网络的理解，而且有助于揭示遗传变异如何导致形态多样性或疾病。在这篇综述中，我们讨论了最近的进展，映射TF结合位点和表征的各种参数的复杂性结合位点识别的TF。
Transcription factors (TFs) play a critical role in determining cell fate decisions by integrating developmental and environmental signals through binding to specific cis-regulatory modules and regulating spatio-temporal specificity of gene expression patterns. Precise identification of functional TF binding sites in time and space not only will revolutionize our understanding of regulatory networks governing cell fate decisions but is also instrumental to uncover how genetic variations cause morphological diversity or disease. In this review, we discuss recent advances in mapping TF binding sites and characterizing the various parameters underlying the complexity of binding site recognition by TFs.
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影响因子：
12.3
作者：
Worsley Hunt R;Wasserman WW
通讯作者：
Wasserman WW
DOI：
10.1093/bioinformatics/btab274
发表时间：
2021-07-12
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Biswas A;Narlikar L
通讯作者：
Narlikar L
影响因子：
4.4
作者：
Deschamps S;Crow JA;Chaidir N;Peterson-Burch B;Kumar S;Lin H;Zastrow-Hayes G;May GD
通讯作者：
May GD
影响因子：
16.6
作者：
Dorrity MW;Alexandre CM;Hamm MO;Vigil AL;Fields S;Queitsch C;Cuperus JT
通讯作者：
Cuperus JT
影响因子：
4
作者：
Inukai S;Kock KH;Bulyk ML
通讯作者：
Bulyk ML