Discovery of proteins associated with a predefined genomic locus via dCas9-APEX-mediated proximity labeling.
Discovery of proteins associated with a predefined genomic locus via dCas9-APEX-mediated proximity labeling.
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DOI：
10.1038/s41592-018-0007-1
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发表时间：
2018-06
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Carr SA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Myers SA;Wright J;Peckner R;Kalish BT;Zhang F;Carr SA
基因表达的调节主要由占据其调节元件的蛋白质的变化控制。染色质免疫沉淀可以确认蛋白质在基因组位点的占有率，但需要针对指定蛋白质的特异性、高质量、IP活性抗体，限制了其实用性。在这里，我们结合联合收割机，基因组靶向，邻近标记，和定量蛋白质组学开发基因组位点蛋白质组学，一种方法，能够识别蛋白质相关的一个特定的基因组位点在天然细胞环境。
Regulation of gene expression is primarily controlled by changes in the proteins that occupy their regulatory elements. Chromatin immunoprecipitation can confirm a protein’s occupancy at a genomic locus but requires specific, high-quality, IP-competent antibodies against nominated proteins, limiting its utility. Here, we combine, genome targeting, proximity labeling, and quantitative proteomics to develop genomic locus proteomics, a method able to identify proteins associated a specific genomic locus in native cellular contexts.
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影响因子：
46.9
作者：
Doench JG;Fusi N;Sullender M;Hegde M;Vaimberg EW;Donovan KF;Smith I;Tothova Z;Wilen C;Orchard R;Virgin HW;Listgarten J;Root DE
通讯作者：
Root DE
DOI：
10.1074/mcp.m114.041012
发表时间：
2015-01
期刊：
Molecular & cellular proteomics : MCP
影响因子：
--
作者：
Keilhauer EC;Hein MY;Mann M
通讯作者：
Mann M
影响因子：
48
作者：
Li T;Wernersson R;Hansen RB;Horn H;Mercer J;Slodkowicz G;Workman CT;Rigina O;Rapacki K;Stærfeldt HH;Brunak S;Jensen TS;Lage K
通讯作者：
Lage K
通过生物素化 dCas9 原位捕获染色质相互作用
影响因子：
64.5
作者：
Liu X;Zhang Y;Chen Y;Li M;Zhou F;Li K;Cao H;Ni M;Liu Y;Gu Z;Dickerson KE;Xie S;Hon GC;Xuan Z;Zhang MQ;Shao Z;Xu J
通讯作者：
Xu J
影响因子：
7.7
作者：
Ly, Tony;Whigham, Arlene;Lamond, Angus I.
通讯作者：
Lamond, Angus I.