Complete protein characterization using top-down mass spectrometry and ultraviolet photodissociation.
Complete protein characterization using top-down mass spectrometry and ultraviolet photodissociation.
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DOI：
10.1021/ja4029654
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发表时间：
2013-08-28
影响因子：
15
通讯作者：
Brodbelt, Jennifer S.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Shaw, Jared B.;Li, Wenzong;Holden, Dustin D.;Zhang, Yan;Griep-Raming, Jens;Fellers, Ryan T.;Early, Bryan P.;Thomas, Paul M.;Kelleher, Neil L.;Brodbelt, Jennifer S.
蛋白质组学的自上而下方法具有显著优势，因为它有可能对蛋白质序列和翻译后修饰进行完整的表征。在此，我们描述了在轨道阱质谱仪中实施193纳米紫外光解离（UVPD）用于完整蛋白质的表征。通过UVPD实现了对高达29 kDa的蛋白质近乎完全的碎片化，包括对Pin1（Q13526，一种与阿尔茨海默病的发展和癌症发病机制有关的蛋白质）上的单个残基突变和几种蛋白质修饰进行明确的定位。UVPD提供的5纳秒高能激活比传统的基于碰撞和基于电子的解离方法对前体离子电荷态的依赖性要小得多。
The top-down approach to proteomics offers compelling advantages due to the potential to provide complete characterization of protein sequence and post-translational modifications. Here we describe the implementation of 193 nm ultraviolet photodissociation (UVPD) in an Orbitrap mass spectrometer for characterization of intact proteins. Near-complete fragmentation of proteins up to 29 kDa is achieved with UVPD including the unambiguous localization of a single residue mutation and several protein modifications on Pin1 (Q13526), a protein implicated in the development of Alzheimer’s disease and in cancer pathogenesis. The 5 nanosecond, high-energy activation afforded by UVPD exhibits far less precursor ion-charge state dependence than conventional collision-based and electron-based dissociation methods.
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影响因子：
4.4
作者：
Madsen JA;Boutz DR;Brodbelt JS
通讯作者：
Brodbelt JS
影响因子：
15
作者：
Kelleher, NL;Lin, HY;McLafferty, FW
通讯作者：
McLafferty, FW
影响因子：
4.2
作者：
Sultana, Rukhsana;Boyd-Kimball, Debra;Butterfield, D. Allan
通讯作者：
Butterfield, D. Allan
影响因子：
7.4
作者：
Gu, CG;Tsaprailis, G;Wysocki, VH
通讯作者：
Wysocki, VH
DOI：
10.1039/c39870000548
发表时间：
1987-04-15
影响因子：
--
作者：
HUNT, DF;SHABANOWITZ, J;YATES, JR
通讯作者：
YATES, JR