Profiling human serum antibodies with a carbohydrate antigen microarray.
Profiling human serum antibodies with a carbohydrate antigen microarray.
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DOI：
10.1021/pr900515y
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发表时间：
2009-09
影响因子：
4.4
通讯作者：
Gildersleeve, Jeffrey C.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Oyelaran, Oyindasola;McShane, Lisa M.;Dodd, Lori;Gildersleeve, Jeffrey C.
最近开发了碳水化合物抗原阵列（聚糖阵列），用于碳水化合物大分子相互作用的高通量分析。在分析血清时，有关实验变异性、个体间生物变异性和个体内时间变异性的信息至关重要。在本报告中，我们描述了碳水化合物抗原阵列的表征以及用于分析人血清的测定。通过优化检测条件和制定标准化策略，我们获得了高度可重复的结果，实验内变异系数 (CV) 为 10.8%，总体 CV（跨多个批次的载玻片和天数）为 28.5%。我们还报告了 48 名人类受试者的抗体谱，并首次评估了年龄、种族、性别、地理位置和血型对大量碳水化合物抗原抗体谱的影响。我们发现各种碳水化合物的抗体水平对年龄和血型有显着依赖性。最后，我们对另外一组 7 名血清捐献者进行了一项纵向研究，以评估个体体内抗碳水化合物抗体水平在 3 至 13 周的时间内的变化，结果发现，对于我们阵列上的几乎所有抗原，抗体水平在这段时间内通常是稳定的。这里提出的结果提供了迄今为止报道的聚糖阵列的实验和生物学变异的最全面的评估，并且对涉及人血清分析的研究具有重要意义。
Carbohydrate antigen arrays (glycan arrays) have been recently developed for the high-throughput analysis of carbohydrate macromolecule interactions. When profiling serum, information about experimental variability, inter-individual biological variability, and intra-individual temporal variability is critical. In this report, we describe the characterization of a carbohydrate antigen array and assay for profiling human serum. Through optimization of assay conditions and development of a normalization strategy, we obtain highly reproducible results with a within-experiment coefficient of variation (CV) of 10.8% and an overall CV (across multiple batches of slides and days) of 28.5%. We also report antibody profiles for 48 human subjects and evaluate for the first time the effects of age, race, sex, geographic location, and blood type on antibody profiles for a large set of carbohydrate antigens. We found significant dependence on age and blood type of antibody levels for a variety of carbohydrates. Finally, we conducted a longitudinal study with a separate group of 7 serum donors to evaluate the variation in anti-carbohydrate antibody levels within an individual over a period ranging from 3 to 13 weeks and found that, for nearly all antigens on our array, antibody levels are generally stable over this period. The results presented here provide the most comprehensive evaluation of experimental and biological variation reported to date for a glycan array and have significant implications for studies involving human serum profiling.
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